Co je degradace proteinu?
buňky rozkládají proteiny z různých důvodů, od jejich inaktivace po použití až po pomoc při buněčné signalizaci. Tento proces, známý jako degradace proteinu nebo proteolýza, probíhá neustále uvnitř buněk. Hladiny proteinu musí zůstat v konkrétních úrovních, aby buňky fungovaly správně, takže buňky mají různé způsoby, jak tyto molekuly trávit. Strukturální proteiny a enzymy mají tendenci trvat déle než regulační proteiny a mohou mít poločasy jednoho až tří dnů. V závislosti na proteinu může být každou hodinu rozloženo kdekoli od méně než 10% dostupných molekul do 100%. ATP je spotřebován speciálními buněčnými enzymy, nazývanými proteázy, jejichž úkolem je trávit proteiny do jejich složky aminokyseliny. Vzhledem k energetickému požadavku proteolýzy k tomu nejedná jednoduše náhodně. Některé sloučeniny místo toho mohou označit proteiNS pro destrukci. Proteiny s delší životností mohou být označeny ubikvitinem, aby je označily za zničení. To upozorňuje větší proteázové komplexy zvané proteazomy, že by měl být protein rozložen. Protein je odebrán dovnitř a štěpen uvnitř proteazomu, struktura existující jak v jádru buněk, tak v těle buněk.
Proteázy, které podporují degradaci proteinu a tvoří proteazom, nejsou vytvářeny ve svých aktivních formách. Jsou vytvářeny jako pre-proteiny, které mají větší velikost. Aktivace těchto proteinů obvykle vyžaduje odstranění inhibičního proteinu nebo štěpení určité oblasti na proteinu.
Existuje několik enzymů, které jsou schopné degradace proteinů. Každý z nich štěpí peptidové vazby, které existují mezi amino aCIDS. Serinové proteázy mají enzymy jako trypsin a elastáza, které k útoku na peptidovou vazbu používají zbytek aminokyseliny. Jiné proteázy používají zinkové, aspartátové zbytky nebo jiné molekuly k podpoře přerušení peptidové vazby.
Struktury zvané lysozomy mohou také degradovat proteiny nespecifickým způsobem. Ty existují jako uzavřené kompartmenty uvnitř buněčné stěny. Jsou schopni rychle vzít proteiny a trávit je.
Přesné míry trávení závisí na určitých podmínkách. Například nedostatek živin tyto sazby urychlí. Méně nezbytné molekuly podléhají nejprve degradaci proteinu, protože jejich proteolýza by uvolnila aminokyseliny za vzniku potřebnějších proteinů.