Hvad er DNA gelelektroforese?
DNA-gelelektroforese er en proces der bruges til at adskille proteiner og nukleinsyrer i molekylærbiologi. Gelen er sædvanligvis sammensat af en tværbundet polymer og acrylamid, som hjælper med at separere og analysere forskellige dele af et DNA-molekyle. DNA-gelelektroforese bruges ofte i retsmedicin til at bestemme den specifikke sekvens af DNA for at hjælpe med at finde den førende mistænkte. Det bruges også ofte inden for genetik og inden for molekylærbiologi og biokemi.
Nukleinsyrer og proteiner har enten en positiv eller negativ ladning. Når de placeres i et elektrisk kammer i DNA-gelelektroforese, vil hver elektrisk ladning bevæge sig mod hver ende af kammeret. De negative elektriske ladede molekyler vil bevæge sig til den positive ende af kammeret, mens de positive elektriske ladede molekyler vil bevæge sig til den negative ende. Gelen adskiller hver af disse molekyler, så de spredes jævnt gennem læsningen. Gelen er sammensat af lange fibre, der forhindrer molekylerne i at bevæge sig for at hjælpe med at analysere de individuelle molekyler.
Sydlig blotting er en teknik, der anvendes i DNA-gelelektroforese til bestemmelse af tilstedeværelsen eller fraværet af en specifik nukleotidsekvens i et DNA-molekyle. Northern blotting er en anden teknik, der bruges til at identificere genekspression i nærvær af RNA eller ribonukleinsyre. Eastern blotting bruges til at bestemme tilstedeværelsen af lipider, proteiner og kulhydrater i en DNA-sekvens. For blot at detektere proteiner i en DNA-sekvens anvendes teknikken til western blotting i elektroforesekammeret gennem gelisolering.
Zymografi er også en tilgang til at detektere visse biologiske funktioner gennem DNA-gelelektroforese. Det bruges hovedsageligt til at undersøge ekstracellulære matrixnedbrydende enzymer, der katalyserer ødelæggelsen af matrixen uden for cellen, såvel som en kældermembran i en celle. Anvendelsen af polyacrylamidgel hjælper til at separere enzymerne, som er proteiner, ved anvendelse af et proteinsubstrat, såsom gelatin eller kasein. Denne teknik bruges til at måle mængden af nedbrydningsaktivitet, der forekommer uden for cellen.
DNA-gelelektroforese anvendes ret ofte i retsmedicin. Det bruges til at adskille blodproteiner og DNA, der findes på en kriminel scene for at bestemme sammenhænge med de tilgængelige mistænkte. Gelelektroforese bruges også til at bestemme en specifik arv inden for genetik, da visse DNA og proteiner er forbundet med forskellige racer. Det bruges også til at løse faderskabssager for at bestemme det relative forhold mellem enkeltpersoner.