Hvad er molekylær grafik?

Udtrykket grafik refererer til tegninger eller billeder, der oprettes efter matematikens regler. Molekylær henviser til molekyler og deres komponenter. Derfor er en betydning af molekylær grafik (MG) studiet af molekyler gennem visualisering af molekylerne i sig selv og deres komponentdele. Molekylær grafik henviser også til de tredimensionelle afbildninger af molekyler, der er lavet for at undersøge dem og forstå deres svar under reaktioner og interaktioner

Molekylær grafik har visse fordele i forhold til fysiske modeller. Fysiske modeller kan forårsage problemer, fordi strukturen er skjult, der er et forkert indtryk af fleksibilitet, overlejring er næsten umulig, eller de er simpelthen for besværlige til at arbejde med. Alle disse problemer kan overvindes med computergrafik.

Én vigtig anvendelse af molekylær grafik er i studiet af proteiner og nukleinsyrer. Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) proteindatabank (PDB), hvor eksperimentelt bestemt information om strukturer af nukleinsyrer, proteiner og komplekse samlinger gemmes til generel adgang. Pr. 27. april 2010 var der 64.932 strukturer i databasen. RCSB populariserer deres funktion med en invitation til besøgende til at bygge 3D-virusmodeller på Rutgers University på Rutgers Day. RCSB sponsorerer også proteinmodelleringsforsøg på regionale videnskabsolympiader i USA. Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) er den internationale organisation, som grupper som RCSB; PDBe, den europæiske modpart; og PDBj, den japanske modpart; tilhører.

Et andet område, hvor molekylær grafik er ekstremt vigtig, er design af lægemidler. Molekylær grafikassisteret lægemiddeldesign - også kendt som computerassisteret lægemiddeldesign (CADD), computerassisteret molekylært design (CAMD) eller strukturbaseret lægemiddeldesign (SBDD) - er en af ​​de vigtigste forskningsinteresser for fakultetet, der er involveret i F.eks. Specialisering af Virginia Commonwealth University Medicinal Chemistry i farmaceutiske videnskabelige programmer.

Specialiseret software til at oprette molekylær grafik, kaldet molekylær design software , er tilgængelig i en række kommercielle pakker. Der er også særlige versioner, der er dedikeret til molekylær-grafisk baseret lægemiddeldesign. I lægemiddeldesign er funktionen ved docking - evnen til at forbinde et vist molekyle til en receptor - en af ​​nøgleegenskaber, der adskiller lægemiddeldesignsoftwaren fra anden molekylær designsoftware.