Hvad påvirker RNA-stabilitet?
Ribonukleinsyre (RNA) stabilitet kan påvirkes af processer inde i en celle såvel som af en række miljøfaktorer. Celler producerer langt flere af disse nukleotidkæder, end de bruger eller har brug for, hvilket indikerer, at nedbrydningsprocesser er på arbejde. Når individuelle enheder af RNA når slutningen af deres brugstid, nedbrydes de også, hvilket illustrerer, at en vis naturlig nedbrydning direkte kodes i deres struktur. Forskere studerer RNA-stabilitet for at lære mere om, hvordan og hvorfor den går i stykker, da disse oplysninger kan være nyttige til opgaver lige fra analyse af RNA i laboratoriet til forståelse af, hvordan organismer trives i ekstreme klimaer.
Inden for individuelle celler er et antal enzymer, der påvirker RNA-stabilitet, i cirkulation. Disse enzymer kan nedbryde RNA til komponenter, som kroppen kan genbruge og genanvende. Intern kodning inden for en RNA-sekvens kan også begrænse strengens levetid. Signaler, der sendes fra andre steder i kroppen, ligesom hormoner, kan også være involveret i processen med at regulere RNA-stabilitet. Cellular messaging bruges til at kontrollere en lang række processer, hvilket gør det kritisk for disse signaler at være i stand til at interagere med RNA.
Miljøfaktorer er en anden medvirkende faktor. Høje temperaturer har tendens til at få RNA til at løsne sig, en proces kaldet denaturering. Dette er et særligt emne af interesse med termofile organismer, der nyder meget høje temperaturer, ligesom orme, der findes omkring hydrotermiske åbninger i havets dybder. Biologer var chokeret over at finde liv ved de ekstreme temperaturer, fordi deres RNA normalt ikke kunne modstå varmen.
Eksponering for toksiner kan også spille en rolle i RNA-stabiliteten. Mennesker, der udsættes for gift, kan opleve en opdeling af cellulære processer, der er medicineret af RNA, fordi deres genetiske materiale begynder at nedbrydes som reaktion på giften. Dette kan også induceres bevidst i tilfælde af medicin, der angriber RNA, der findes i mikroorganismer, for at interferere med deres reproduktionsprocesser. Medikamenterne klæber til målstrenge for at trække dem fra hinanden, hvilket får organismen til at dø.
I laboratorieindstillinger er RNA-stabilitet en vigtig overvejelse. Prøver, der evalueres, skal have intakt, rent RNA for at opnå de bedste resultater. Anlægget skal muligvis nøje overveje opbevaringsmuligheder for at bevare integriteten af prøver. Kemiske buffere og andre værktøjer tilvejebringer en mekanisme til at bevare prøver så effektivt som muligt for at gøre det muligt at studere dem og stole på resultaterne. Kriminalteknisk undersøgelse kræver især rene prøver, da resultaterne kan bruges ved en domstol.