Hvad er en proteinligand?
En proteinligand binder til receptorsteder på overfladen af et protein. Ligander er involveret i en lang række processer, fra proteinfoldning til ændringsstruktur, og de giver en funktion i immunreaktioner. De er et emne med tæt undersøgelse i forskningsfaciliteter, da de spiller en vigtig rolle i sundhedsapplikationer. Specialdesignede medicin kan for eksempel drage fordel af forskningen om en proteinligand. Disse strukturer kan også give indsigt i funktionen af forskellige proteiner.
atomer, molekyler og ioner kan alle fungere som proteinligander. Et klassisk eksempel er et antistof. Antistoffer låser sig fast på receptorsteder på overfladen af proteiner som dem, der fandt studding den eksterne konvolut af vira. Enzymer og en række andre strukturer inde i kroppen bruger proteinliganden i deres konstruktion for at muliggøre forskellige funktioner.
I videnskabelig forskning kan folk se på et protein til at identificere potentielle bindings- eller dockingsteder. Placeringen af webstederKan give information om, hvilken slags protein det er, og hvilke funktioner det skal udføre i kroppen. Denne søgning kan også udføres omvendt ved at identificere ligander og finde ud af, hvad de potentielt kan binde til, når de cirkulerer gennem kroppen. Nogle ligander har et bredt spektrum af handling og kan oprette forbindelse til en række forskellige proteiner, mens andre er ekstremt præcise.
Lægemiddeludvikling bruger proteinligandforskning. Farmaceutiske virksomheder er nødt til at identificere mål på celler og strukturer som vira for effektivt at behandle patienter. Ved at finde et protein, der er unikt for en bestemt organisme, kan virksomheden for eksempel udvikle en proteinligand, der vil låse sig fast på det, bære medicin for at dræbe organismen eller stoppe dens reproduktion. Identifikation af målproteiner kan også hjælpe med udviklingen af vacciner.
Disse strukturer kan også være af interesseFor virksomheder, der udvikler laboratorieundersøgelser. En test kan drage fordel af kendte ligander og proteiner til at markere strukturer af interesse i en prøve. For eksempel, hvis en læge ønsker at finde ud af, om en patient har en virusinfektion, kan laboratoriet introducere ligander med tags, der fluorescerer. Hvis vira er til stede i prøven, klæber liganderne sig på og lyser op for at vise tilstedeværelsen af infektion.
Databaser af proteiner og ledsagende ligander er tilgængelige. Mange er frie at bruge i interessen for at fremme videnskabelig forskning. Private databaser, der vedligeholdes af medicinalfirmaer, kan indeholde proprietær information, der bruges i lægemiddeludvikling. I processen med at ansøge om patenter skal virksomheden forklare, hvordan et lægemiddel fungerer, og dette kan give oplysninger om det anvendte mål, så andre virksomheder kan tage forskningen endnu mere.