Was ist ein Microarray?
Ein Microarray ist eine Folge von DNA-, Protein- oder Gewebepunkten, die zur einfachen gleichzeitigen Analyse auf einem Array angeordnet sind. Das bekannteste ist das DNA-Microarray, das eine wichtige Rolle bei der Erstellung von Genexpressionsprofilen spielt. Das Substratmaterial ist Glas, Kunststoff oder ein Siliziumchip. Alternative Namen für den DNA-Mikroarray sind Gen-Chip , DNA-Chip und Biochip . Die kleinen DNA-Stücke heißen Sonden .
Ein Microarray kann auf verschiedene Arten hergestellt werden. Am primitivsten ist es, die DNA lediglich mit Stiften auf Objektträger zu tropfen. Anspruchsvollere Techniken setzen Fotolithografie, elektrochemische Ansätze und sogar Tintenstrahldruck ein - alles, was die DNA präzise an einen Punkt liefern kann.
Der DNA-Microarray ist ein Produkt der späten 1980er und frühen 1990er Jahre, als die Biotechnologie wirklich auf dem Vormarsch war. Mit dem Microarray können Forscher eine Reihe von Tests mit allen Proben gleichzeitig durchführen, wodurch die Forschung erheblich beschleunigt wird. Traditionelle biologische Experimente arbeiten nacheinander an Dingen. Die Sonden werden manchmal mit Punkten markiert, die als Fluorophore bezeichnet werden, wenn sie nicht leicht voneinander zu unterscheiden sind.
Einige der größten Microarrays von Unternehmen wie NimbleGen Systems enthalten bis zu 390.000 Spots. Der Microarray wird häufig zur Analyse des gesamten Genoms eines Organismus verwendet, der Dutzende oder mehr Chromosomen mit jeweils eigener DNA und RNA enthalten kann. Leider sind nicht alle Microarrays miteinander kompatibel und es gibt einen offensichtlichen Mangel an Standards. Standardisierungsbemühungen sind im Gange, aber noch ohne großen Erfolg.
Wie die meisten hochmodernen Forschungspläne für die Biotechnologie können bei Tests mit dem Microarray riesige Datenmengen erzeugt werden, wodurch das Gebiet der Bioinformatik entsteht , das alles zu verstehen versucht. Es kann Entdeckungen und Korrelationen geben, die wir bereits gemessen haben, aber aufgrund des Datenüberlaufs einfach nicht bemerkt haben. Das Data Mining wird intensiv genutzt, um die Ergebnisse dieser komplexen Experimente zu analysieren.