¿Qué es el análisis de microarrays?
El análisis de microarrays de ADN se usa en biología molecular y medicina diagnóstica para determinar qué genes en una célula se encienden en cierto punto en el tiempo. Esta técnica se conoce como un ensayo multiplex, porque puede medir miles de muestras en un solo ensayo. Las técnicas de microanálisis de ADN se utilizan para interpretar datos de ensayos realizados en ARN y ADN, dependiendo de los requisitos particulares del experimento.
La base del análisis de microarrays de ADN es la alta especificidad de las moléculas de ADN y la capacidad de elegir secuencias únicas de ADN para representar un gen particular. Se lleva a cabo un experimento de análisis de microarrays en una superficie sólida hecha de un vidrio o chip de silicona en el que se coloca una matriz química. En la superficie de la matriz de ADN o sondas de ARN se alinean en filas ordenadas.
Una vez que el chip se ha configurado con las sondas requeridas, se preparan las células que se estudian. Para preparar las células, deben abrirse para que los ácidos nucleicos que contenganpuede ser aislado. Se agregan una serie de reactivos para extraer y concentrar los ácidos nucleicos contenidos dentro de las células. A continuación, el extracto de ácido nucleico se agrega al chip, que luego se deja durante varias horas para permitir el tiempo para que las sondas interactúen y se unan a los ácidos nucleicos celulares. Finalmente, se agregan una serie adicional de reactivos al ChIP para identificar ubicaciones donde los ácidos nucleicos celulares se han unido a las sondas.
El análisis de microarraysse usa para determinar qué sondas han podido detectar ácidos nucleicos celulares. Este es a menudo un análisis complejo, ya que un solo chip puede contener decenas de miles de sondas únicas. El orden de las sondas en el chip se almacena en una base de datos de computadora para que los resultados se puedan obtener fácilmente. Usando el chip y la base de datos, un científico puede desarrollar una lista de genes que se unieran a las sondas y, por lo tanto, estuvieron presentes en el extracto celular original.
La técnica de análisis de microarrays se usa comúnmente en el perfil de expresión génica. En este tipo de experimento, la microarray se establece para examinar los patrones de expresión génica en las células. Las sondas para los genes de interés se incluyen en la microarrays, y cuando el experimento se completa, el análisis de datos de microarrays puede determinar cuáles de los genes que se estudiaban se encendieron en un momento particular.
Otros usos para esta técnica incluyen hibridación genómica comparativa y detección de SNP. La hibridación genómica comparativa es una prueba que examina el contenido genómico en las células de organismos relacionados. Este tipo de ensayo proporciona información sobre las relaciones genéticas entre diferentes especies.
La detecciónSNP es una técnica que puede usarse en análisis forense, análisis de vinculación genética y evaluación de riesgos de enfermedad genética. Los SNP son polimorfismos de un solo nucleótido, ubicaciones en el genoma en el que hay dos posibles secuencias de pares de bases. Los SNP pueden proporcionar una variedad de útilesInformación genética debido al hecho de que existen diferentes variaciones de SNP en diferentes poblaciones étnicas y geográficas.