Qu'est-ce qu'un kilobase?
Une kilobase est une mesure de numérotation utilisée dans le domaine de la génétique. Comme une base est un élément constitutif de l'information génétique, et chaque organisme contient de nombreuses bases, 1 000 bases est un nombre commun à utiliser pour déterminer le nombre de bases contenues dans la bibliothèque génétique d'un organisme. Ce bloc de 1 000 bases est plus précisément appelé kilobase.
Chaque organisme vivant contient des informations génétiques. Cette information précise à l'organisme les produits protéiques dont il a besoin pour vivre, se développer et se multiplier. L'ensemble de l'information génétique est appelé le génome de l'organisme.
Chaque génome est divisé en sections distinctes. Ces sections, appelées gènes, codent pour un produit particulier. Chaque gène contient une chaîne de blocs de construction, appelés bases. Lorsque l'organisme lit les gènes pour produire un produit particulier, c'est la séquence de bases à l'intérieur du gène qu'il lit.
Il n’existe que quatre bases dans l’ADN du matériel génétique. Ce sont la cytosine (C), la guanine (G), la thymine (T) et l'adénine (A). C'est l'ordre dans lequel les bases sont arrangées dans un gène qui dicte ce que ce gène code. La complexité nécessaire à la production de tous les produits essentiels à la vie humaine découle de la longueur des gènes et du nombre de bases qui y sont contenus.
Les gènes contiennent chacun un nombre remarquable de bases. Le génome humain entier, par exemple, contient 3 milliards de bases, chacune couplée à une autre base dans une structure hélicoïdale en spirale. La quantité considérable de bases présentes dans un génome signifie que les généticiens ont plus de facilité à se référer aux gènes comme étant une longueur de x kilobases, par opposition à une longueur de 1 000 fois x.
Même le plus petit des génomes, tel que le génome de la bactérie Carsonella ruddii , contient environ 160 000 paires de bases. Ce petit génome a une longueur d’environ 160 kilobases (kb). Le génome humain, en revanche, a une longueur de 3 millions de kilobases.
Le séquençage des génomes nécessite que le génome soit divisé en premier. L'équipement qui effectue le séquençage ne peut gérer qu'un nombre aussi grand de bases à la fois. Les généticiens peuvent diviser un génome en plusieurs sections et les considérer comme contenant autant de paires de kilobases, telles qu'une longueur de 150 paires de kilobases. Cette taille de matériel génétique peut être génétiquement modifiée dans un autre organisme afin de multiplier l'ADN jusqu'à un niveau facilement lisible. Même ces fragments d'ADN, relativement petits, sont trop longs pour permettre le séquençage direct. Les généticiens peuvent alors fractionner un segment de 150 kb en parties beaucoup plus petites, de quelques centaines de bases de long.