Qu'est-ce que la marche chromosomique?
La marche chromosomique est une méthode de clonage positionnel utilisée pour rechercher, isoler et cloner un allèle particulier dans une bibliothèque de gènes. Un allèle est un gène d'un trait génétique particulier transmis par les adultes à leur progéniture, tel que l'allèle des yeux bruns dans un gène de la couleur des yeux. Parfois, l'emplacement approximatif d'un seul allèle dans une chaîne d'acide désoxyribonucléique (ADN) peut être connu. Pour isoler un allèle particulier d'une maladie transmise génétiquement, il peut être nécessaire d'explorer le chromosome en recherchant le spécimen souhaité dans une séquence d'ADN non cartographiée en dehors des séquences cartographiées précédemment.
Pour localiser un gène de maladie particulier, la marche commence au gène le plus proche déjà identifié, appelé gène marqueur. Chaque gène successif dans la séquence est testé à plusieurs reprises pour ce qui est connu sous le nom de restrictions de chevauchement et cartographié pour leur emplacement précis dans la séquence. Finalement, parcourir les gènes atteint le gène mutant dans une séquence non cartographiée qui se lie à un fragment d'un gène de cette maladie particulière. Une fois le gène cloné, sa fonction peut être entièrement identifiée. Tout au long de ce processus, des tests sont effectués pour identifier complètement les propriétés de chaque clone successif, afin de cartographier leurs emplacements pour une utilisation future.
Près d'une demi-douzaine de tests de clonage de position sont effectués avant une promenade chromosomique, afin de préciser autant que possible les séquences génétiques particulières pouvant contenir le gène mutant souhaité pour une maladie. Une fois que les marqueurs situés de part et d'autre d'une séquence probable non cartographiée ont été trouvés, la marche des chromosomes peut commencer à partir de l'un des marqueurs. Les tests sur chaque clone successif sont complexes, prennent du temps et varient selon les espèces. Il existe différents tests pour les gènes liés aux maladies des plantes que pour les gènes impliqués dans une bibliothèque de gènes humains.
Le clonage positionnel utilise des marqueurs génétiques connus pour habiter les chromosomes d'individus atteints de maladies spécifiques. Ces bases de données de traits communs connus permettent des tests qui peuvent être utilisés pour identifier des individus pouvant ou non posséder certains gènes récessifs pour une maladie qui ne s'est pas encore manifestée. La marche des chromosomes, ainsi que tous les autres tests effectués avant la marche des chromosomes, nécessitent des laboratoires exceptionnellement bien équipés pour effectuer toutes les phases de clonage, les examens et l'analyse des mutations détectées.