Apa itu ubiquitination uji?

Ubiquitination mengacu pada pengikatan protein ubiquitin dengan protein lain dengan tiga enzim yang berbeda.Uji ubiquitination adalah tes yang menentukan seberapa banyak proses ini terjadi di dalam sel.Tes dapat digunakan untuk menentukan bagaimana kondisi yang berbeda mempengaruhi pengikatan protein, langkah dan struktur yang penting dalam jalur ubiquitinnation, dan jumlah protein dalam sel.Jumlah yang tidak memadai atau berlebihan telah dikaitkan dengan pengembangan banyak penyakit yang berbeda.

Protein yang ditemukan dalam sel, fungsi ubiquitin adalah untuk mengikat protein sambil berfungsi sebagai tag atau sinyal ke struktur lain.Tag ini kemudian menandakan enzim untuk mengetahui bahwa protein dapat dihancurkan, didaur ulang, atau dipindahkan.Hasilnya adalah penghancuran atau transportasi protein.

Protein penandaan ini penting untuk perbaikan DNA, infeksi virus dan respons imun.Fungsi penting lainnya termasuk peran dalam kematian sel, pembelahan sel dan pengembangan sel.Terlalu banyak ubiquitin, atau ketiadaannya, dapat memainkan peran dalam pembentukan banyak penyakit, seperti kanker, gangguan genetik dan penyakit sistem kekebalan tubuh.

Peneliti akan menggunakan uji ubiquitination untuk mencoba menentukan kondisi mana yang mengubah konsentrasi protein dalam sel dan membandingkan sel yang sakit dengan sel -sel sehat.Para ilmuwan juga menggunakannya untuk menyelidiki kondisi apa yang akan menyebabkan perubahan ikatan.Selain itu, mereka dapat mencoba menghubungkan kode DNA spesifik dengan jumlah enzim dalam sel.

Ada lebih dari satu jenis uji ubiquitination yang digunakan oleh para ilmuwan penelitian secara khusus.Seseorang akan menentukan persentase protein yang terikat dengan ubiquintin.Lain meneliti aktivitas enzim atau adanya perantara lain yang ditemukan di jalur ubiquination.Tes yang berbeda dikembangkan berdasarkan protein target yang akan diikat ubiquitin.

Dasar uji ubiquitination adalah untuk menggabungkan senyawa yang diberi label menggunakan bahan kimia lain yang mudah diukur.Dalam uji onkologi, ubiquitin dapat diberi label dengan cryptate, senyawa yang mengandung dua atom nitrogen.Ini dapat digunakan untuk menentukan enzim mana yang paling aktif dalam sel.

Ubiquitination uji akan memiliki dua langkah.Yang pertama adalah langkah enzimatik di mana enzim akan mengikat ubiquitin berlabel ke protein target.Yang kedua adalah langkah deteksi di mana pengikatan protein target diperiksa menggunakan konjugat seperti antibodi.Antibodi akan melakukan fluorese, atau mengubah warna, yang kemudian memungkinkan peneliti untuk menentukan aktivitas enzim.