Apa itu analisis microarray?

Analisis mikroarray DNA digunakan dalam biologi molekuler dan kedokteran diagnostik untuk menentukan gen mana dalam sel yang diaktifkan pada titik waktu tertentu.Teknik ini dikenal sebagai uji multipleks, karena dapat mengukur ribuan sampel dalam satu uji.Teknik analisis mikro DNA digunakan untuk menafsirkan data dari pengujian yang dilakukan pada RNA serta DNA, tergantung pada persyaratan khusus dari percobaan.Urutan DNA untuk mewakili gen tertentu.Eksperimen analisis microarray dilakukan pada permukaan padat yang terbuat dari gelas atau chip silikon yang diletakkan matriks kimia.Pada permukaan matriks DNA atau probe RNA berbaris di baris tertib.

Setelah chip telah diatur dengan probe yang diperlukan, sel yang dipelajari disiapkan.Untuk menyiapkan sel, mereka harus dipatahkan terbuka sehingga asam nukleat yang dikandungnya dapat diisolasi.Serangkaian reagen ditambahkan untuk mengekstrak dan memusatkan asam nukleat yang terkandung dalam sel.Selanjutnya, ekstrak asam nukleat ditambahkan ke chip, yang kemudian dibiarkan selama beberapa jam untuk memberikan waktu bagi probe untuk berinteraksi dan berikatan dengan asam nukleat seluler.Akhirnya, serangkaian reagen lebih lanjut ditambahkan ke chip untuk mengidentifikasi lokasi di mana asam nukleat seluler telah terikat pada probe.

analisis microarray kemudian digunakan untuk menentukan probe mana yang dapat mendeteksi asam nukleat seluler.Ini sering merupakan analisis yang kompleks, karena satu chip tunggal mungkin mengandung puluhan ribu probe unik.Urutan probe pada chip disimpan dalam database komputer sehingga hasilnya dapat diperoleh dengan mudah.Menggunakan chip dan database, seorang ilmuwan dapat mengembangkan daftar gen yang telah terikat dengan probe dan karenanya ada dalam ekstrak seluler asli.

Teknik analisis microarray umumnya digunakan dalam profil ekspresi gen.Dalam jenis percobaan ini, microarray diatur untuk memeriksa pola ekspresi gen dalam sel.Probe untuk gen yang menarik dimasukkan pada microarray, dan ketika percobaan selesai, analisis data microarray dapat menentukan gen mana yang dipelajari yang diaktifkan pada waktu tertentu.

Penggunaan lain untuk teknik ini termasuk hibridisasi genomik komparatif dan deteksi SNP.Hibridisasi genomik komparatif adalah tes yang meneliti konten genom dalam sel organisme terkait.Jenis uji ini memberikan informasi tentang hubungan genetik antara spesies yang berbeda.

Deteksi SNP adalah teknik yang dapat digunakan dalam analisis forensik, analisis hubungan genetik, dan penilaian risiko penyakit genetik.SNP adalah polimorfisme nukleotida tunggal, lokasi pada genom di mana ada dua kemungkinan urutan pasangan basa.SNP dapat memberikan serangkaian informasi genetik yang berguna karena fakta bahwa variasi SNP yang berbeda ada dalam populasi etnis dan geografis yang berbeda.