Apa itu retrotransposon?

Transposon adalah potongan DNA yang mobile, atau dapat pindah ke tempat yang berbeda dalam informasi genetik sel.Dengan pindah ke lokasi baru dalam genom sel, transposon dapat menyebabkan mutasi terjadi, serta mengubah jumlah DNA yang ditemukan di dalam sel.Mereka juga disebut sebagai gen lompat, dan dikelompokkan ke dalam dua kategori yang merupakan transposon kelas II dan transposon kelas I, atau retrotransposon.Perbedaan antara kedua kelas ini berkaitan dengan bagaimana mereka bergerak;Retrotransposon memiliki proses pergerakan dua langkah.

Metode pergerakan segmen DNA adalah bagaimana transposon diklasifikasikan ke dalam setiap kategori.Transposon Kelas II adalah bagian dari DNA yang bergerak dari satu tempat ke tempat lain.Pergerakan transposon Kelas I, atau retrotransposon, jauh lebih kompleks, dan melibatkan dua langkah untuk pergerakan segmen DNA.

Langkah pertama untuk pergerakan retrotransposon adalah membuat segmen RNA melalui transkripsisepotong DNA.RNA sekarang bebas bergerak di seluruh genom karena tidak terikat pada untaian DNA.Ketika RNA mencapai lokasi baru, enzim spesifik, yang disebut reverse transcriptase, membuat untaian DNA baru berdasarkan segmen RNA.Sepotong DNA baru ini kemudian melekat pada lokasi baru dalam genom.

Ketika retrotransposon ditranskripsikan kembali ke segmen DNA dari salinan RNA, biasanya memiliki pengulangan terminal panjang (LTR) pada akhir urutan DNA.LTR terdiri dari urutan pengulangan pangkalan yang bisa ratusan atau bahkan ribuan pangkalan.Mereka biasanya mengelilingi bagian fungsional DNA, seperti gen, dan diperlukan untuk melampirkan segmen DNA ke untai DNA asli.LTR adalah salah satu cara yang dapat dikenali oleh para ilmuwan bahwa bagian DNA mengandung retrotransposon.Diperkirakan bahwa sekitar 42% dari seluruh genom manusia terdiri dari retrotransposon.

Karena fakta bahwa salinan DNA baru dilakukan melalui transkripsi terbalik RNA, menambahkan retrotransposon adalah cara untuk meningkatkan jumlah DNAditemukan dalam satu sel.Jika retrotransposon dimasukkan dalam gen atau dekat gen, maka itu dapat menyebabkan mutasi terjadi.Mutasi pada dasarnya adalah perubahan pada urutan DNA dan dapat memiliki dampak positif, negatif atau tidak ada pada genom, tergantung pada bagaimana urutan DNA diubah.