Apa itu endopeptidase?
Endopeptidase adalah jenis protease, enzim dari kelompok besar yang mendegradasi protein.Enzim adalah protein yang membuat reaksi terjadi jauh lebih cepat.Protein terdiri dari rantai asam amino, dihubungkan oleh ikatan peptida.Tautan ini menghubungkan terminal karboksil dari satu asam amino dengan terminal amino berikutnya.Endopeptidase membelah ikatan peptida asam amino dalam protein, berbeda dengan exopeptidases , yang membelah ujung protein.
endopeptidase ditemukan di semua kelas organisme dan memiliki berbagai aktivitas biologis.Mereka terlibat dalam pencernaan protein dalam makanan.Ini termasuk enzim pepsin, trypsin, dan chymotrypsin.Protease juga terlibat dalam pensinyalan seluler dengan memecah protein lain, seperti antibodi atau hormon.Mereka dapat menghidupkan atau mematikan jalur.
Protease biasanya pertama kali dibuat sebagai molekul yang lebih besar yang tidak aktif.Ini melindungi sel yang mensintesisnya dari rusak.Setelah protease dikirim ke targetnya, misalnya perut, sepotong molekul dihilangkan.Ini mengaktifkan protease.
Karena banyak sekali peran dalam fungsi seluler, ada banyak minat medis dalam aktivitas endopeptidase.Salah satu contohnya adalah prolyl endopeptidase, yang terpotong secara khusus setelah asam amino prolin.Ini telah dikaitkan dengan gangguan psikologis, seperti depresi, mania, dan skizofrenia.Ada minat klinis pada prolyl endopeptidase inhibitor sebagai kemungkinan anti-depresan.
Contoh lain adalah endopeptidase netral, yang memiliki beberapa nama lain.Ia juga dikenal sebagai neprilysin dan antigen leukemia limfoblastik akut (Calla).Protease ini menurunkan peptida kecil yang disekresikan, termasuk peptida yang telah terlibat sebagai penyebab penyakit Alzheimer, dan beberapa peptida pensinyalan penting.Endopeptidase netral kadang -kadang digunakan sebagai penanda kanker, tetapi perannya dalam kanker tidak jelas.Inhibitor telah dikembangkan untuk membantu menghilangkan rasa sakit dan kontrol tekanan darah tinggi. Endopeptidase ditempatkan dalam keluarga yang berbeda, tergantung pada struktur situs aktif mereka dan kondisi yang mereka sukai.Ada protease serin, yang memiliki serin asam amino di situs aktif mereka.Anggota keluarga ini termasuk protease pencernaan trypsin dan chymotrypsin, bersama dengan prolyl endopeptidase.Salah satu inhibitor yang sering digunakan di laboratorium penelitian biokimia adalah senyawa yang sangat beracun phenylmethanesulfonylflouride (PMSF).Ini digunakan selama isolasi protein dan pemurnian untuk menghambat aktivitas protease serin, yang dapat menurunkan protein yang dimurnikan. Protease sistein memiliki gugus sulfur di situs aktif mereka dan umum dalam buah.Enzim ini ditemukan dalam pelayar daging.Papain adalah contoh endopeptidase semacam itu dan digunakan untuk mengobati sengatan lebah dan tawon.Situs aktif protease aspartik umumnya berisi dua kelompok aspartat.Metalloendopeptidases membutuhkan kofaktor logam untuk aktivitas.Endopeptidase netral adalah bagian dari keluarga ini, membutuhkan seng untuk aktivitas.