In biologia, che cos'è Nick Translation?
Nel campo della biologia, la traduzione del nick è un processo usato per sostituire alcune molecole che formano filamenti di DNA con molecole simili che producono una caratteristica specifica desiderata, spesso una caratteristica che consente a queste molecole di essere facilmente individuate e identificate durante un esperimento. Un enzima noto come DNA polimerasi I provoca la sostituzione di alcune molecole di DNA, note come nucleotidi, con nuovi nucleotidi. I nuovi nucleotidi vengono scelti specificamente dagli scienziati che eseguono l'esperimento.
Spesso la traduzione del nick viene utilizzata per procedure scientifiche come la carta assorbente. Ciò comporta l'isolamento e l'esame dei ceppi di DNA per determinare in cosa consiste il nucleotide e quindi l'esecuzione di esperimenti sul particolare filamento di DNA. Conoscere diverse sequenze di DNA può aiutare a isolare una mutazione o creare un anticorpo per combattere un virus.
Il processo di traduzione del nick coinvolge quelli che vengono definiti enzimi di restrizione utilizzati per eseguire tagli o "intaccature" sulla sequenza del DNA. Un enzima di restrizione è progettato per tagliare una sequenza di DNA in una posizione specifica ed è un tipo di meccanismo di difesa utilizzato per distruggere virus dannosi. Gli scienziati hanno messo l'enzima di restrizione per lavorare tagliando pezzi di DNA in modo da poterli sostituire con nuovi pezzi.
Una volta realizzati i nick, vengono utilizzati enzimi specifici per riparare il DNA con nucleotidi speciali progettati per facilitare lo studio del DNA. Gli scienziati studiano questa nuova sequenza di DNA per vedere come reagisce a se stesso o ad altri oggetti e avere questi nucleotidi con tag semplifica il processo di monitoraggio e studio da vicino del filamento di DNA. Un esempio comune è l'inserimento di nucleotidi marcati che si illuminano quando posti sotto una luce nera, rendendoli così facili da individuare.
Un altro esempio comune di uno dei molti usi della traduzione del nick è l'ibridazione in situ fluorescente. Questo processo consente a uno scienziato di cercare specifiche sequenze di DNA per vedere se sono presenti o meno in un filamento di DNA. La traduzione di nick può dare a questi filoni di proprietà fluorescenti del DNA così brillano e lo scienziato può usarlo per aiutare a identificare quali sequenze di DNA sono presenti e quali sono assenti.
I nucleotidi rimossi e poi sostituiti attraverso la traduzione del nick sono spesso definiti "DNA spazzatura". Gli scienziati non sono ancora stati in grado di trovare alcun tipo di scopo a cui servono queste molecole di DNA. Sembrano non funzionare e non portano il codice per nessun tipo di proteina, come è tipico del DNA più utile.