Quali sono i diversi tipi di kit di isolamento RNA?
La maggior parte dei kit di isolamento dell'acido ribonucleico (RNA) è in grado di isolare RNA di alta qualità da un'ampia gamma di tessuti e tipi di organismi, tra cui piante, animali e virus. L'RNA mitocondriale e ribosomiale - rispettivamente mRNA e rRNA - può richiedere kit di isolamento RNA specifici specifici per piccoli filamenti di RNA. Altri fattori che possono differire tra i vari kit di isolamento sono la quantità di campioni che ogni kit può elaborare e il tempo impiegato per elaborare completamente un campione.
I tipi più comuni di kit di isolamento RNA possono essere utilizzati per una grande varietà di applicazioni, indipendentemente da dove provenga l'RNA. Le cellule e i tessuti dei mammiferi sono tra le fonti predominanti utilizzate per l'isolamento e la purificazione dell'RNA. Le cellule vegetali e i virus vengono utilizzati anche in esperimenti di biologia molecolare che richiedono l'uso di un kit di isolamento dell'RNA.
Una volta raccolto il campione di tessuto o sangue, deve essere preparato per l'isolamento dell'RNA durante un processo critico noto come degradazione, separazione o interruzione cellulare. Se il materiale cellulare non viene completato interrotto, il processo di isolamento dell'RNA produrrà meno RNA. I migliori kit di isolamento dell'RNA includono materiali e forniture per il degrado cellulare prima dell'isolamento e della purificazione dell'RNA dopo l'isolamento.
In casi speciali in cui un esperimento richiede mRNA o rRNA, sono disponibili kit di isolamento RNA specializzati per fili di RNA particolarmente piccoli. I materiali e le forniture inclusi in tale kit possono differire in termini di quantità e dimensioni. Questi kit di isolamento RNA sono meno comuni dei kit RNA multiuso e potrebbe esserci una sostanziale differenza di costo.
Molti comuni kit di isolamento RNA sono progettati per l'uso con tutti i tipi di tessuti e cellule e possono completare una reazione entro circa 20 minuti. Il tempo necessario per la completa degradazione cellulare può variare a seconda di dove nell'organismo sono state raccolte le cellule. Oltre alla fase di degradazione cellulare, il processo di isolamento dell'RNA e la successiva purificazione sono relativamente standard in termini di procedura e tempo.
Un'altra caratteristica che può essere specifica per determinati kit è la quantità di campione richiesta per elaborare la reazione. Mentre alcuni kit di isolamento possono richiedere un volume del campione relativamente grande, altri kit possono funzionare bene con un volume inferiore. Questa differenza può essere un vantaggio se il volume del campione è un fattore limitante.
Diversi produttori di kit di isolamento RNA hanno grafici comparativi disponibili su Internet. Questi grafici possono essere usati per vedere le differenze tra i vari kit che producono. Le differenze possono includere tipi di applicazioni specializzate, sostanze chimiche e volumi di campioni richiesti.