Cos'è un trascrittoma?
Il trascrittoma è una raccolta completa di RNA da un organismo, un gruppo di cellule o persino una cellula specifica. L'RNA è sintetizzato dal DNA attraverso un processo noto come trascrizione. L'RNA presente in una cellula e il corpo determina quali geni verranno espressi e cambia nel corso della vita di un organismo, a differenza del DNA, che rimane statico. La pressione ambientale è una delle principali ragioni dei cambiamenti, poiché il corpo tenta di adattarsi alle mutevoli situazioni ambientali per mantenerlo funzionante.
Il trascrittoma è molto più piccolo del genoma di un organismo, la completa raccolta di DNA nell'organismo. Metti in termini semplici, si potrebbe pensare al DNA come a un libro di cucina, elencando una raccolta completa di ricette che possono essere fatte. Il trascrittoma è il codice che determina quali ricette verranno effettuate e quando. Il libro di cucina rimane statico per tutta la vita, mentre il trascrittoma cambia in risposta ai fattori ambientali.
Una parte importante del trascrittomaE è molecole di mRNA. L'RNA di messaggero è l'RNA che comunica con i ribosomi nelle cellule per dirigere le cellule per creare varie proteine. Queste proteine sono utilizzate per un'ampia varietà di funzioni. Altre parti potrebbero non codificare direttamente per la produzione di proteine, ma fanno cose come determinare la struttura cellulare e regolare l'espressione genica. Insieme, i vari componenti del trascrittoma mantengono un organismo funzionante e determinano l'espressione genica all'interno di quell'organismo.
All'interno di varie cellule del corpo, il trascrittoma può essere molto diverso. Le cellule epatiche, ad esempio, hanno l'RNA che le rende cellule epatiche e assicura che le cellule svolgano funzioni necessarie. Le cellule della pelle, d'altra parte, hanno un trascrittoma diverso che attiva i geni necessari per rendere una cellula una cellula della pelle. Sia il fegato che le cellule della pelle hanno una copia completa del genoma, ma i loro trascrittomi determinano quali parti delIl genoma è attivato.
Proprio come con il DNA, è possibile sequenziare l'RNA. Il sequenziamento del trascrittoma può essere fatto per saperne di più sulle azioni di una cellula e del DNA dell'organismo ospitante e per identificare i luoghi in cui l'espressione delle informazioni genetiche va storto. Quando una cellula epatica diventa maligna, per esempio, è perché il trascrittoma non funziona come dovrebbe essere e i geni per la malignità si sono attivati, o le cellule mancano in qualche modo, facendole crescere dal controllo. Il sequenziamento dell'RNA in una cellula maligna può aiutare un ricercatore a capire quale gene è stato attivato o inattivato per causare malignità.