亜硫酸水素塩シーケンスとは

亜硫酸水素塩シーケンスは、メチル化を使用してDNAのさまざまな領域を分析する方法です。 メチル化は、メチル基と呼ばれる特定の分子をヌクレオチド、この場合は通常シトシンに追加するプロセスです。 不活性ヌクレオチドはしばしばメチル化されるため、この方法は、ゲノムの活性領域の決定から遺伝子の豊富な領域の特定まで、さまざまな目的に使用できます。 バイサルファイトシーケンシングでは、メチル化シトシンはシーケンシングプロセスの影響を受けませんが、非メチル化シトシンはウラシルに変換されます。ウラシルは、遺伝物質であるデオキシリボ核酸（DNA）には通常見られないヌクレオチドです。

この方法はメチル化の変化に非常に敏感であるため、結合のわずかな変化により、研究者は特定のヌクレオチドに関する特定の情報を得ることができます。 亜硫酸水素ナトリウムはシトシンをウラシルに変換しますが、メチル化シトシンがこの変化を受けない環境で変換が行われます。 亜硫酸水素塩の配列決定が完了すると、元のDNAは大幅に異なる分子に変換されました。 シトシンは非常に枯渇するか、潜在的に欠乏します。 この変換された分子にまだシトシンが見つかった場合、シトシンは考慮中のゲノム内の自然にメチル化されたシトシンを表します。

すべての実験プロトコルと同様に、亜硫酸水素塩シーケンスには欠点があります。 その最大の欠点は、適切に機能するために非常に高い塩濃度が必要であることです。 塩は一本鎖DNAのアニーリングを促進してより自然な二重らせんにし、重亜硫酸ナトリウムは二本鎖DNAの一部であるときは常にシトシンに到達することはできません。 塩濃度が高すぎると、多数のシトシンがウラシルに変換されず、ゲノム内のメチル化シトシンが誤って識別される可能性があります。 偽陽性の識別の数を最小限に抑えるために、変性剤が必要になる場合があります。

亜硫酸水素塩シーケンスには大量のゲノムデータは必要ないため、この方法には臨床サンプルの分析に役立つアプリケーションがあります。 元の核酸ソースは重要ではありませんが、ソースはDNAでなければなりません。 理論的には、ほとんどのRNAは一本鎖であり、ヌクレオチドがブロックされているために偽陽性の影響を受けにくいため、この方法を使用してリボ核酸（RNA）をシーケンスできます。 ただし、RNAには自然にウラシルが含まれているため、実際に使用する場合、RNAには重亜硫酸塩シーケンスは役立ちません。 何らかの外部マーキングやプロトコルへの追加がなければ、変換されたシトシンは天然のウラシルと見分けがつきません。

あらゆる種類のシーケンス手法を実施する場合、精度と精度が不可欠です。 バイサルファイトシーケンシングなどの高感度メソッドは、信頼性の高いシーケンス分析手段を提供します。これにより、遺伝子分析や、薬物や治療のターゲットの特定が可能になります。 この方法は生きている人には使用できませんが、使用する組織サンプルのごく一部のみを使用する場合には、依然として非常に役立ちます。