게놈 브라우저 란 무엇입니까?
게놈 브라우저는 염색체의 물리적지도를 보는 데 사용되는 웹 인터페이스입니다. 이지도는 염기쌍으로 측정했을 때 두 유전자를 분리하는 DNA의 양을 보여줍니다. 인간 염색체의 크기는 5 천만 내지 2 억 5 천만 염기쌍 범위이다. 게놈 브라우저는 전체 염색체뿐만 아니라 단일 유전자의 "확대"회로도 및 실제 염기쌍 서열의 도식적 표현을 보여줍니다.
게놈 브라우저를 통해 사용자는 염색체를 스크롤하고 특정 위치를 확대 할 수 있습니다. 많은 게놈 브라우저는 사용자가 실제 DNA 서열을 보는 수준에서 확대 할 수있게하지만, 브라우저의 실제 유용성은 뉴클레오티드 수준에서 DNA 서열을 보는 것이 아니라 더 큰 맥락에서 유전자를 보는 능력에있다. 유전자의 평균 크기는 3,000 개의 염기쌍이므로, 염기쌍 수준에서 확대하면 전체 유전자보다 적게 볼 수 있습니다. 가장 큰 인간 유전자 인 디스트로핀은 240 만 염기쌍 길이입니다.
유전자의 도식적 표현을 보는 것 외에도, 게놈 브라우저는 다른 유용한 정보를 보여줄 수도 있습니다. 이것은 mRNA로 불리는 단백질로 번역되는 유전자의 부분 및 단백질을 코딩하는 것 이외의 기능을 갖는 DNA 서열을 포함 할 수있다. 게놈 브라우저는 또한 게놈 시퀀싱 과정에서 사용 된 DNA 세그먼트를 보여줄 수 있습니다.
다수의 유기체가 게놈을 시퀀싱했습니다. 게놈 분야에 표준 인 단일 브라우저가 없으므로 게놈 브라우저는 시퀀싱 된 게놈마다 다를 수 있습니다. 게놈 브라우저는 관심 유전자 또는 서열을 검색 할 수있는 기능을 가지고있어 사용자가 한 게놈 위치에서 다른 게놈 위치로 이동할 수 있습니다. 대부분의 염색체가 크기 때문에 염색체를 스크롤하여 관심있는 위치에 도달하는 것은 비효율적입니다.
일부 게놈 브라우저에는 유전자 분류기라는 도구가 있습니다. 이 도구는 서로 관련된 유전자 표를 표시합니다. 관계는 서열 상 동성, 유사한 발현 프로파일 또는 게놈 근접성 등 여러 유형 중 하나 일 수있다. 사용자는 단어 나 구를 사용하여 유전자를 검색하고 원하는 관계 유형을 선택하며 유전자 분류기는 검색 결과를 표시합니다.