아연 핑거 란?
징크 핑거는 징크 이온에 결합하는 단백질의 특정 아미노산에 의해 형성된 핑거 형태의 단백질 폴드입니다. 이들 단백질은 그 모양이 DNA 및 RNA의 뉴클레오티드와 도메인의 밀접한 상호 작용을 허용하기 때문에 종종 DNA 및 RNA에 결합한다. 이들의 뉴클레오티드 결합 특성은 유전자 발현 조절 및 바이러스 조립에서 기능 할 수있게한다.
징크 핑거 구조에는 여러 가지 유형이 있지만 가장 일반적인 버전은 알파 나선 및 베타 시트로 구성되며, 단백질에서 두 가지 가장 일반적인 2 차 구조 인 하나 이상의 징크 이온 양쪽에 있습니다. 알파 나선 및 베타 시트는 시스틴 및 히스티딘 잔기에 의해 위치가 유지되며, 질소 및 황 원자를 통해 아연 이온을 조정한다. 징크 핑거는 DNA에 결합하고, DNA 이중 나선의 중심에서 염기 쌍과 그 주변의 아미노산과의 상호 작용을 통해 결합합니다. 그것은 단백질 도메인이 작고 크기가 작기 때문에 DNA 염기쌍과 근접 할 수 있습니다.
이 단백질은 살아있는 유기체에서 가장 일반적인 전사 인자입니다. 전사 인자는 DNA에 결합하여 유전자 정보를 RNA로 전달하는 것을 제어하는 단백질입니다. DNA를 표적으로하는 이들 단백질은 관심있는 DNA 서열을 표적으로하기 위해 의도적 인 리엔지니어링 후보가되었다.
예를 들어, ZFN (Zinc Finger Nuclease)은 제한 엔도 뉴 클레아 제 또는 DNA- 절단 효소에 융합 된 조작 된 징크 핑거 결합 도메인을 갖는 합성 단백질이다. ZFN은 특정 위치에서 DNA를 절단하는데 사용될 수 있으며, DNA의 부위-특이 적 재조합을 촉진시키는 유용한 도구이다. 조작 된 징크 핑거는 또한 인공 전사 인자로 사용될 수 있습니다.
아연 핑거 도메인은 인간 면역 결핍 -1 (HIV-1) 바이러스의 네오 캡시드 (NC) 단백질을 포함하여 일부 바이러스 성 단백질에서 발견된다. NC는 바이러스 조립에 중요하고 보존성이 높기 때문에 매력적인 항 바이러스 표적입니다. 바이러스 및 레트로 바이러스 단백질의 징크 핑거를 특이 적으로 표적화하는 억제제를 사용하여 바이러스 복제를 방지 할 수있다. 이러한 성질의 항 바이러스 화합물을 얻는 것은 생물 의학 연구의 활발한 분야입니다.
이 단백질은 세포의 정상적인 신진 대사에서 중요한 역할을합니다. 효과적이기 위해서는, 항 레트로 바이러스 화합물은 구체적으로 레트로 바이러스 징크 핑거 단백질을 표적으로해야한다. 이러한 레트로 바이러스 단백질은 세포 성 징크 핑거 단백질과 구별되는 아미노산 서열 및 구조적 차이를 가지므로, 선택적 억제제를 얻는 것이 달성 가능한 목표이다.