Wat is een microsatelliet?

Een microsatelliet is een korte, zich herhalende reeks DNA. Omdat ze de neiging hebben weinig te variëren tussen nauw verwante organismen, worden microsatellieten door wetenschappers vaak gebruikt als genetische markers om individuen te identificeren die uit dezelfde fokpopulatie komen. Ze staan ​​ook bekend als korte tandemherhalingen (STR's) en eenvoudige reeksherhalingen (SSR's).

Als je denkt dat een DNA-molecule lijkt op een ladder, dan bestaat elke sport in de ladder uit een paar kleinere moleculen die nucleotiden worden genoemd. De vier nucleotiden die in DNA verschijnen zijn adenine (A), guanine (G), thymine (T) en cytosine (C). Adenineparen met thymine en guanineparen met cytosine. De volgorde waarin deze basenparen verschijnen, geeft een DNA-streng zijn unieke handtekening en vormt een code die genetische informatie opslaat.

Een microsatelliet treedt op wanneer een korte reeks basenparen, meestal tussen 1 en 6, zich meerdere keren achter elkaar herhaalt. Het volgende diagram van een korte DNA-streng toont een enkele microsatelliet samengesteld uit de eenheid GTC op de bovenste helft en CAG op de onderste helft, elk 4 keer herhaald. Wetenschappers zouden dit weergeven als (GTC) ₄ of (CAG) ₄ :

         GTCGTCGTCGTC
         |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
         CAGCAGCAGCAG

Deze groepen zich herhalende sequenties werden "microsatellieten" genoemd omdat, wanneer DNA wordt gescheiden door het in een centrifuge te spinnen, het de neiging heeft zich te groeperen in een grote hoofdband omgeven door kleinere "satelliet" -banden. Onderzoekers noemden het DNA dat ze in deze banden vonden minisatellieten en microsatellieten. Minisatellieten zijn langere segmenten, die kunnen bestaan ​​uit maximaal ongeveer 100 herhalende basenparen.

Microsatellietmarkers zijn vaak nuttig voor het identificeren van individuen uit dezelfde fokpopulatie. Zelden treden mutaties op wanneer een genetische sequentie wordt doorgegeven van een ouder op een kind, wat resulteert in meer of minder eenheden van het zich herhalende segment. In ons voorbeeld hierboven zou (CAG) ₄ dus (CAG) ₃ of (CAG) _{5 kunnen worden} . Deze mutaties komen vaak genoeg voor dat een wilde fokpopulatie waarschijnlijk andere microsatellieten heeft dan andere fokgroepen, maar ze komen niet vaak genoeg voor dat individuen binnen een enkele fokgroep waarschijnlijk bepaalde karakteristieke sequenties delen.

De meeste microsatellieten worden gevonden in niet-coderend DNA - DNA dat niet de "code" of instructies heeft om eiwit te produceren. Bijgevolg wordt niet aangenomen dat ze een belangrijke rol spelen in het functioneren van cellen. Er is echter reden om aan te nemen dat een microsatelliet normale celprocessen kan verstoren als deze te groot wordt. In het geval van de ziekte van Huntington kan het aantal herhalingen van een bepaalde sequentie bijvoorbeeld het verschil betekenen tussen de ziekte of een niet-aangetaste drager.