Wat is een microsatelliet?

Een microsatelliet is een korte, repetitieve sequentie van DNA. Omdat ze de neiging hebben om weinig te variëren tussen nauw verwante organismen, worden microsatellieten vaak door wetenschappers gebruikt als genetische markers om individuen te identificeren die uit dezelfde fokpopulatie komen. Ze staan ​​ook bekend als korte tandemherhalingen (STR's) en eenvoudige sequentieverhalingen (SSR's).

Als men denkt aan een molecuul DNA als op een ladder lijkt, dan bestaat elke beurt in de ladder uit een paar kleinere moleculen die nucleotiden worden genoemd. De vier nucleotiden die in DNA verschijnen, zijn adenine (A), guanine (G), thymine (T) en cytosine (C). Adenineparen met thymine en guanineparen met cytosine. De volgorde waarin deze basisparen verschijnen, geeft een streng DNA zijn unieke handtekening en vormt een code die genetische informatie opslaat.

Een microsatelliet treedt op wanneer een korte reeks basenparen, meestal tussen 1 en 6, meerdere keren in een rij herhaalt. Het volgende diagram van een korte streng DNA toont een enkeleMicrosatelliet samengesteld uit de eenheid GTC op de bovenste helft en cag op de onderste helft, elk 4 keer herhaald. Wetenschappers zouden dit vertegenwoordigen als (GTC) 4 of (cag) 4 : 

        G T C G T C G T C G T C
        | | | | | | | | | | | |
        C a g c a g c a g c a g

Deze groepen herhalende sequenties werden "microsatellieten" genoemd omdat, wanneer DNA wordt gescheiden door het in een centrifuge te draaien, het de neiging heeft om te groeperen in een grote hoofdband omringd door kleinere, "satelliet" banden. Onderzoekers noemden het DNA dat ze in deze bands vonden, minisatellieten en microsatellieten. Minisatellieten zijn langere segmenten, die kunnen bestaan ​​uit maximaal ongeveer 100 herhalende basenparen.

Microsatellietmarkers zijn vaak nuttig voor het identificeren van individuen uit dezelfde fokpopulatie. Zelden treden mutaties op wanneer een genetische sequentie wordt doorgegeven van een ouder naar kind, wat resulteert in meer ofMinder eenheden van het herhalende segment. In ons bovenstaande voorbeeld zou (cag) 4 dus (cag) 3 of (cag) 5 kunnen worden (cag). Deze mutaties komen vaak genoeg voor dat een wilde fokpopulatie waarschijnlijk verschillende microsatellieten heeft dan andere fokgroepen, maar ze komen niet vaak genoeg voor dat individuen binnen een enkele fokgroep waarschijnlijk bepaalde karakteristieke sequenties delen.

De meeste microsatellieten zijn te vinden in niet-coderend DNA-DNA dat niet de "code" of instructies heeft om eiwitten te produceren. Bijgevolg wordt er niet aangenomen dat ze een belangrijke rol spelen bij het functioneren van celfuncties. Er is echter reden om te geloven dat een microsatelliet normale celprocessen kan verstoren als deze te groot wordt. In het geval van de ziekte van Huntington kan het aantal herhalingen van een bepaalde volgorde bijvoorbeeld het verschil betekenen tussen het beïnvloeden door de ziekte of een niet-getroffen drager zijn.

ANDERE TALEN