Wat is een plantengenoom?

Een plantengenoom is de opeenvolging van DNA die de informatie biedt voor een plant om te leven. Binnen alle levende organismen bestaat het genoom uit het genetische materiaal voor dat organisme. De DNA-moleculen zijn gegroepeerd in genen die de instructies geven die bepalen wat een plant doet, zijn kleur, vorm en grootte, waar en hoe het groeit, etc. Elk levend organisme heeft een genoom dat bestaat uit al zijn genen die bepalen wat dat organisme is.

Elk genoom, inclusief een plantengenoom, bestaat uit een reeks nucleotiden die het DNA van dat organisme vormen. Er zijn vier soorten nucleotiden gevonden in DNA, die alanine (A), thymine (T), guanine (G) en cytosine (C) zijn. De reeksen nucleotiden kunnen erg lang zijn en hun volgorde is wat de genen vormt. In plaats van een lange DNA-streng zijn de genen gegroepeerd op chromosomen die worden gevonden in de kern van elke cel van het organisme. Naast verschillende genen hebben verschillende soorten organismen ook verschillende aantallen chromosomen.

Het bestuderen van genomen wordt al jaren door wetenschappers uitgevoerd. Genetici hebben geprobeerd de genen te vinden die coderen voor bepaalde eigenschappen en functies van levende wezens. Tot voor kort waren ze beperkt in wat ze kunnen vinden, maar ze hebben nu methoden ontwikkeld of de hele reeks nucleotiden gevonden die een genoom vormen. Om een ​​plantengenoom te sequencen, moet de wetenschapper elke nucleotide bepalen die wordt gevonden in elk chromosoom van de plant die wordt bestudeerd.

Het bepalen van de sequenties van plantengenomen is niet eenvoudig geweest vanwege het brede scala aan planten, evenals het grote verschil in hun genomen. Het bereik van plantgenoomgroottes varieert van soorten met genomen die zo klein zijn als die van kleine dieren tot andere planten met genomen die bijna veertig keer zo groot zijn als het menselijk genoom. Het allereerste plantengenoom dat volledig werd gesequenst, was de Arabidopsis-plant, een kleine tuinkersplant die deel uitmaakt van de mosterdfamilie. Deze plant is gekozen omdat deze een relatief kort genoom heeft in vergelijking met andere planten. Sequencing van het Arabidopsis-genoom heeft aangetoond dat het 25.000 genen heeft, die nu worden gebruikt om de genoomsequentie te bepalen van planten die veel langere en veel complexere genomen hebben.