Wat is een stopcodon?

Een stopcodon is een nucleïnezuur-triplet in messenger RNA (mRNA) dat niet codeert voor een aminozuur, waardoor de productie van een eiwit wordt gestopt. In wezen vertelt het stopcodon de ribosomen die de mRNA-code uitvoeren dat het tijd is om te stoppen; je zou het bijna kunnen zien als een geperforeerde lijn in een vel papier dat "traan hier" aangeeft. Zonder een stopcodon zouden eiwitten gemaakt van RNA bestaan ​​uit eindeloze ketens van aminozuren, omdat de ribosomen niet zouden weten wanneer ze moesten stoppen .

Stopcodons zijn ook aanwezig in DNA, zodat ze worden overgedragen wanneer DNA wordt omgezet in RNA. In DNA zijn de drie stopcodons TAA, TAG en TGA. Deze triplets zijn "onzin" codons die nergens voor coderen, waardoor het risico dat er een fout wordt gemaakt, wordt verkleind. Wanneer getranscribeerd in RNA, zijn de stopcodons UAA, UAG en UGA.

De lengte van een aminozuurketen in een eiwit kan variëren, wat betekent dat stopcodons met variërende intervallen worden gevonden bij het coderen van DNA en RNA, de gebieden van de genetische code die informatie bevatten die moet worden uitgevoerd om eiwitten te maken. Stopcodons kunnen worden geïdentificeerd wanneer DNA wordt gesequenced en kunnen worden gebruikt om de specifieke locaties in de genetische code te identificeren die overeenkomen met bepaalde eiwitten, en daarmee met bepaalde genetische informatie.

Net als bij andere delen van DNA, is het mogelijk dat een mutatie in een stopcodon verschijnt. Het codon kan onjuist worden getranscribeerd of nucleïnezuren in het codon kunnen worden uitgewisseld, wat problemen veroorzaakt wanneer de ribosomen het mRNA gaan vertalen om aminozuurketens te bouwen. In een enkele cel kan dit resulteren in een willekeurige mutatie waardoor de cel sterft of defect raakt. Als er echter fouten optreden in de stopcodons in een kiemcel en die kiemcel samengaat met een van een ander organisme, heeft het resulterende organisme een aangeboren mutatie en in sommige gevallen kan de mutatie zo ernstig zijn dat het organisme niet kan leven .

Genetici kunnen hun kennis van stopcodons gebruiken om de informatie in een stuk DNA of RNA te ordenen. Door te zoeken naar stopcodons, kunnen ze specifieke ketens van aminozuren identificeren en bepalen voor welke eiwitten het genetische materiaal codeert. Deze informatie kan worden gebruikt om meer te weten te komen over wat het doet en wat er gebeurt als het fout gaat. Het vinden van een stopcodon kan nuttig zijn bij het bestuderen van DNA en RNA om meer te leren over een geïdentificeerde mutatie of variatie.