Wat is eukaryote transcriptie?
Binnen alle levende cellen is transcriptie het proces dat RNA-strengen produceert, die worden gecodeerd op basis van het DNA dat in de cellen wordt gevonden. Het RNA wordt vervolgens gebruikt om eiwitten in het cytoplasma van een cel te maken. Binnen verschillende organismen kan het transcriptieproces enigszins verschillen. Dit geldt met name wanneer we kijken naar eukaryoten en prokaryoten; de term eukaryote transcriptie beschrijft het proces binnen eukaryoten.
Het belangrijkste verschil tussen eukaryotische organismen en prokaryotische organismen is de aanwezigheid van membraangebonden organellen in de cellen. Eukaryoten hebben membraangebonden organellen, zoals de kern en mitochondriën, terwijl prokaryoten dat niet doen. Dit is een van de eerste en meest voor de hand liggende verschillen tussen prokaryotische en eukaryotische transcriptie, omdat het bepaalt waar het proces plaatsvindt. Eukaryotische transcriptie vindt plaats in de kern en mitochondriën, want dat is waar het DNA wordt gevonden in dit soort cellen. Dientengevolge moet translatie plaatsvinden na transcriptie in eukaryoten omdat het RNA vanuit de kern naar het cytoplasma moet worden getransporteerd.
Bijna alle eukaryote DNA wordt in de kern gevonden, dus dit is de primaire locatie voor de meeste transcriptie. Wanneer het DNA wordt getranscribeerd, wordt een bepaald gebied van het DNA afgewikkeld zodat het enkelstrengig is. Dit gebied wordt een cistron genoemd en het codeert uiteindelijk voor een eiwit na transcriptie en translatie. In de meeste gevallen zijn er drie enzymen die betrokken zijn bij eukaryotische transcriptie versus slechts één voor prokaryotische transcriptie.
De enzymen die bij transcriptie betrokken zijn, worden RNA-polymerasen genoemd en de drie verschillende zijn RNA-polymerase I (RNA Pol I), RNA-polymerase II (RNA Pol II) en RNA-polymerase III (RNA Pol III). Het type RNA bepaalt welke van de drie polymerasen tijdens transcriptie wordt gebruikt. RNA Pol I transcribeert ribosomaal RNA (rRNA), dat wordt gebruikt om de ribosomen in het cytoplasma te maken en waar translatie plaatsvindt. Messenger RNA, de strengen die de code voor de eiwitten leveren, wordt getranscribeerd door RNA Pol II. Het derde enzym, RNA Pol III, transcribeert DNA in transfer RNA (tRNA), dat wordt gebruikt om de juiste aminozuren naar de ribosomen te dragen voor het maken van de eiwitstrengen.
Tijdens eukaryote transcriptie beweegt een van de RNA-polymerasen langs de enkele DNA-streng. Terwijl het dit doet, creëert het een RNA-streng door een RNA-nucleotide toe te voegen dat complementair is aan degene die wordt gevonden in de DNA-streng. De RNA-nucleotiden zweven vrij in de kern en worden aangetrokken door de enkele ongebonden DNA-streng. Nadat het cistron is getranscribeerd, moet de nieuwe RNA-streng door poriën in het kernmembraan reizen, zodat translatie in het cytoplasma kan plaatsvinden.