Wat is ribosomale RNA -sequencing?
Ribosomale ribonucleïnezuur (RNA) sequencing is het proces van het bepalen van het sequentie -gehalte van de nucleïnezuren die het ribosoom vormen. In bijna alle cellen zijn ribosomen macromoleculen die eiwitten bouwen om de cel te laten draaien. Ze bestaan uit RNA en een verscheidenheid aan eiwitten die het RNA helpen efficiënter te werken. Veel van dit materiaal in een ribosoom is direct betrokken bij het bouwen van eiwitten, dus het bepalen van ribosomale RNA -sequencing kan inzichten geven in de uiteindelijke structuur van het molecuul, evenals hoe het werkt. De functie en de algemene structuur van het RNA is goed geconserveerd tussen een verscheidenheid aan soorten, maar de ruwe volgorde is dat niet, en veranderingen in de sequentie kunnen worden gebruikt om informatie over de evolutie van het ribosoom af te leiden.
Of het nu wordt gebruikt voor bacteriële ribosomen of die van meer complexe organismen, ribosomale RNA -sequencing wordt op een vergelijkbare manier bereikt. Zodra het RNA is gescheiden van het ribosoom, wordt het vele malen gedupliceerd en vervolgens uit elkaar gebroken in een klein fragmentS wiens sequenties gemakkelijk kunnen worden geïdentificeerd. Die kleine sequentiestukken worden vervolgens opnieuw samengesteld om de nieuw bepaalde reeks te genereren. De taak wordt gecompliceerder naarmate een sequentie langer wordt, maar het proces is nog steeds relatief eenvoudig voor ribosomaal RNA, dat relatief klein is. Er is geen garantie dat een eerste poging tot ribosomale RNA -sequencing de eerste keer correct zal zijn, dus meerdere pogingen om te controleren of de gegevenskwaliteit meestal worden uitgevoerd.
De gegevens verkregen uit ribosomale RNA -sequencing kunnen worden gebruikt voor verschillende doeleinden, maar een van de meest voorkomende is voor bacteriële identificatie. Vooral bacteriële ribosomaal RNA is sterk geconserveerd tussen soorten, dus sequencing maakt het mogelijk om de unieke kenmerken van een soort te gebruiken in een profiel ter referentie. Dit profiel kan worden gebruikt om snel en gemakkelijk een specifiek type bacteriën te identificeren, een test die kanHulp bij de diagnose en behandeling van de zieken. Met de komst van betere sequencing -technologie is deze aanpak vaker voorgekomen in diagnoses.
Een tweede impact ribosomale RNA -sequencing kan hebben op de menselijke gezondheid, is het ontwerpen van drugs en medicijnen. Bacteriële ribosomale RNA -sequenties hebben veel subsequenties die uniek zijn voor bacteriën, dus het richten op deze regio's met antimicrobiële medicijnen kan bacteriën doden zonder schadelijk te zijn voor mensen. Ribosomale RNA -sequentiegegevens op zichzelf bieden niet voldoende gegevens om medicijnen te maken, maar het geeft wetenschappersregio's om zich op te focussen voor toekomstig onderzoek en drugsontwerp. Medicinale moleculen kunnen worden ontworpen die aan de sequenties worden bevestigd en het ribosoom uitschakelen. Een verscheidenheid aan huidige geneesmiddelen gebruikt deze techniek om ziekten te bestrijden.