Wat is totaal RNA?

Ribonucleïnezuur (RNA) is een polymeer dat betrokken is bij eiwitsynthese, genreplicatie en replicatie van deoxyribonucleïnezuur (DNA). Een polymeer is een molecuul gemaakt van lineaire ketens, dus RNA is een lineaire keten gemaakt van ribonucleotiden. Elk ribonucleotide-molecuul bestaat uit een stikstofbase met een fosfaatgroep en ribose. Totaal RNA verwijst naar RNA dat is geëxtraheerd of geïsoleerd uit cellen of weefsel met het oog op genetische kartering. Dit type volledig RNA kan worden geïsoleerd uit eencellige organismen, dierlijk weefsel, plantenweefsel, gist en schimmel

Totaal RNA wordt uit cellen en weefsel geëxtraheerd tijdens een proces dat RNA-isolatie wordt genoemd. Celdisruptie is de eerste en belangrijkste stap in dit proces en de cellen kunnen worden verstoord door mechanische middelen, zoals homogenisatie, of door de toevoeging van enzymen. Enzymen breken de coating of capsule van een cel chemisch af, zodat het totale RNA kan worden geïsoleerd. Tijdens de isolatie van totaal RNA worden lipiden, eiwitten en DNA uit het RNA verwijderd, zodat het in zijn puurste vorm blijft.

Er zijn een aantal verschillen tussen RNA en DNA, hoewel de twee nucleotiden aan elkaar koppelen om ketens te vormen. RNA is een polymeer met een enkele keten, terwijl DNA dubbelstrengig is. Bovendien bevat DNA deoxyribose, terwijl RNA alleen ribose bevat.

Hoewel de meest basale structuur van RNA een keten is, kan RNA secundaire en tertiaire structuren hebben. Secundaire structuren zijn vaak spiraalvormig en omvatten haarspelden, lussen en knoopachtige vormen. Tertiaire structuren zijn het meest complex en treden op wanneer verre nucleotiden op elkaar inwerken. Wetenschappers gebruiken deze structuren om de functies van verschillende RNA-moleculen te begrijpen en te bepalen.

Nadat een RNA-molecuul tijdens de transcriptie is gesynthetiseerd, moet het worden verwerkt voordat het klaar is om de beoogde functie te vervullen. Verwerking omvat het veranderen van segmenten of strengen van specifieke nucleotiden. RNA-moleculen met verschillende functies hebben verschillende namen. Messenger-RNA (mRNA) wordt bijvoorbeeld genoemd omdat het verantwoordelijk is voor de overdracht van de genetische code van DNA naar de ribosomen die tijdens de eiwitsynthese worden gebruikt.

Eiwitsynthese, waarnaar wetenschappelijk wordt verwezen als vertaling, vereist naast mRNA twee extra soorten RNA. Translatie-RNA, of tRNA-moleculen, passen nucleotiden binnen mRNA aan aan aminozuren tijdens translatie. Het RNA-molecuul dat verantwoordelijk is voor het koppelen van ribosomen aan groeiende eiwitketens wordt rRNA genoemd. De drie belangrijkste soorten RNA moeten aanwezig zijn voor meerdere RNA-functies. Bovendien spelen de meeste minder gebruikelijke soorten RNA een rol bij de vertaling door essentiële functies in de kern en het cytoplasma uit te voeren.