Hva er molekylær grafikk?

Begrepet grafikk refererer til tegninger eller bilder som er laget etter matematikkens regler. Molekylær refererer til molekyler og deres komponenter. Derfor er en betydning av molekylær grafikk (MG) studiet av molekyler gjennom visualisering av molekylene selv og deres komponentdeler. Molekylær grafikk refererer også til de tredimensjonale skildringene av molekyler som er laget for å undersøke dem og forstå deres svar under reaksjoner og interaksjoner

Molekylær grafikk har visse fordeler i forhold til fysiske modeller. Fysiske modeller kan forårsake problemer fordi strukturen er skjult, det er et falskt inntrykk av fleksibilitet, overlagring er nesten umulig, eller de er ganske enkelt for tungvint å jobbe med. Alle disse problemene kan overvinnes med datamaskingrafikk.

En nøkkelbruk av molekylær grafikk er i studiet av proteiner og nukleinsyrer. Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) proteindatabank (PDB), der eksperimentelt bestemt informasjon om strukturene til nukleinsyrer, proteiner og komplekse enheter er lagret for generell tilgang. Fra 27. april 2010 var det 64 932 strukturer i databasen. RCSB populariserer funksjonen sin med en invitasjon til besøkende om å bygge 3D-virusmodeller ved Rutgers University på Rutgers Day. RCSB sponser også proteinmodellforsøk på regionale Science Olympiads i USA. Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) er den internasjonale organisasjonen som grupper som RCSB; PDBe, den europeiske motparten; og PDBj, den japanske motparten; tilhøre.

Et annet område der molekylær grafikk er ekstremt viktig er utformingen av legemidler. Molekylær grafikkassistert medikamentdesign - også kjent som datamaskinassistert medikamentdesign (CADD), datamaskinassistert molekylær design (CAMD), eller strukturbasert medikamentdesign (SBDD) - er en av de viktigste forskningsinteressene til fakultetet som er involvert i Virginia Commonwealth University medisinsk kjemi spesialisering i farmasøytiske vitenskaper kandidater, for eksempel.

Spesialisert programvare for å lage molekylær grafikk, kalt molekylær designprogramvare , er tilgjengelig i en rekke kommersielle pakker. Det er spesielle versjoner som er viet til molekylær-grafikkbasert medikamentdesign. I legemiddeldesign er funksjonen til dokking - evnen til å koble et vist molekyl til en reseptor - en av nøkkelegenskapene som skiller medisindesignprogramvaren fra annen molekylær designprogramvare.