Hva er Aminoacyl tRNA?

Aminoacyloverførings ribonukleinsyre (aminoacyl tRNA) brukes til å omsette sekvenser av mRNA til proteiner. Aminoacyl tRNA består av en streng av RNA som inkluderer en gruppe på tre nukleotider, kalt et kodon, som er knyttet til en aminosyre. Hvert kodon er paret til en spesifikk aminosyre, selv om det er en viss overflødighet; noen aminosyrer er paret med flere kodoner. Denne formen for tRNA hjelper til med å transportere aminosyrer til ribosomet, der translasjon finner sted, og tRNA-kodonet pares deretter med en komplementær sekvens på mRNA-strengen, slik at dens kognate aminosyre kan bli med i polypeptidkjeden dannet under translasjon. Gjennom denne prosessen kan genetisk informasjon som opprinnelig var inneholdt i strengen av tRNA, konverteres til aminosyrer som brukes til å danne proteiner.

Etter at tRNA-molekyler er transkribert fra DNA-sekvensen som koder for dem, er det en to-trinns prosess for å konvertere disse tRNA-strengene til aminoacyl-tRNA-molekyler. Disse reaksjonene finner sted inne i det spesifikke aminoacyl tRNA-syntetase-enzymet for en gitt aminosyre. Det er 20 typer av disse enzymene i alt, en for hver aminosyre.

Til å begynne med må aminosyren som skal parres for tRNA-sekvensen aktiveres. Dette oppnås ved å adenylere aminosyren eller binde den til et adenosinmonofosfat (AMP) molekyl i en energikrevende reaksjon. TRNA overføres deretter til aminosyre-AMP-komplekset, og fjerner AMP for å feste seg til aminosyren. AMP i denne reaksjonen kommer fra adenosintrifosfat (ATP), som konverteres til AMP og et pyrofosfatmolekyl som gir energi til denne reaksjonen.

Aminoacyl tRNA-syntetaseenzymer er makromolekyler som gjenkjenner hvilke tRNA-sekvenser som kobles til riktig aminosyre på et par forskjellige måter. Enzymene har antikodonregioner av sitt eget tRNA, som kan gjenkjenne sekvensene av tRNA-kodoner. Alternativt kan enzymet gjenkjenne akseptorsider på tRNA-sekvenser som er lokalisert i hver ende av molekylene.

Disse flere gjenkjennelsesstedene sikrer at aminosyrer er paret til de riktige tRNA-sekvensene, og er spesielt viktige for aminosyrer som serin, som kan samsvare med seks forskjellige kodoner av tRNA. TRNA-sekvensene inneholder også genetisk informasjon bortsett fra et kodon og akseptorsider. Det er diskriminatorbaser rundt kodonet som forhindrer at galt aminoacyl tRNA-syntetaseenzym tar opp det og bruker det i en reaksjon.