I biologi, hva er en konsensus -sekvens?
En konsensus -sekvens er et sett med proteiner, eller nukleotider i deoksyribonukleinsyre (DNA), som vises regelmessig. Aminosyrene adenin, guanin, cytosin og tymin utgjør genetiske sekvenser i DNA. Molekylære biologer bruker ofte statistikk for å forutsi hvor en viss sekvens av dem vil være, eller for å forstå hvor bestemte molekyler har en tendens til å binde seg. Hvor aminosyresekvensene forblir de samme og hvor de har en tendens til å variere, kan bli representert med en formel. Når det gjelder en konsensuspromotersekvens, kan en bestemt type enzym binde seg til steder med lignende sekvenserte proteiner.
genetikere, som forskere i mange vitenskapelige fagområder, bruker ofte substitusjoner for å forenkle komplekse systemer. Det er så mange aminosyrebaser og gener i kroppen at forskere ikke kan telle dem med mindre det er noe generelt system for å gjøre det. En konsensus -sekvens kan også vises mange steder i DNA i forskjellige levende ting. Likhetene og forskjellene som har en tendens til å oppstå CAn indikeres med en formel.
Statistisk sett kan forskere klassifisere genetiske sekvenser for å se etter mønstre. Gjenta mønstre, kalt sekvensmotiver, brukes vanligvis til å representere genetiske områder som kontrollerer spesifikke biologiske prosesser. Konsensus -sekvenser kan også gi innsikt i hvordan proteiner syntetiseres eller hvordan molekyler blir guidet i en celle.
I notasjonen av en konsensus -sekvens kan plasseringen av noen nukleotider vise at de alltid er på det representerte stedet. Det kan også indikeres at ett nukleotid eller et annet kan være der. I dette tilfellet er hvor ofte en aminosyre vises, i stedet for en annen, generelt ikke oppgitt. En grafisk modell brukes noen ganger for å indikere denne frekvensen, ved å øke eller redusere størrelsen på symbolene. Noen programmer kan generere sekvenslogoer automatisk.
Ofte samsvarer en konsensus -sekvens med en RECOgnisert proteinbindingssted. For nøyaktig å skildre sekvenser på genomet, brukes ofte matematiske formler. Disse inkluderer statistiske formler som logaritmer og numeriske verdier, som kan være positive eller negative, for å representere plasseringen av genetisk informasjon. Prosesser i genomet for normale biologiske funksjoner, så vel som de som er relatert til sykdommer, kan analyseres på denne måten.
De matematiske representasjonene av en konsensus -sekvens gir generelt en modell av DNA og aminosyremønstre. Et eksakt bilde er vanligvis ikke gitt. Sekvensene kan imidlertid hjelpe forskere med å relatere de funksjonelle aspektene ved forskjellige deler av genomet til evolusjonsmønstre av organismer.