Hva er Nick-oversettelse innen biologi?

Innen biologi er nick-translasjon en prosess som brukes til å erstatte visse molekyler som utgjør DNA-tråder med lignende molekyler som produserer en spesifikk, ønsket egenskap, ofte en egenskap som gjør at disse molekylene lett kan oppdages og identifiseres under et eksperiment. Et enzym kjent som DNA Polymerase I får visse DNA-molekyler, kjent som nukleotider, erstattet med nye nukleotider. De nye nukleotidene er plukket ut spesielt av forskerne som utfører eksperimentet.

Ofte brukes nick-oversettelse til vitenskapelige prosedyrer som blotting. Dette innebærer å isolere og undersøke stammer av DNA for å bestemme hvilke nukleotider det består av og deretter utføre eksperimenter på den spesielle DNA-strengen. Læring om forskjellige DNA-sekvenser kan bidra til å isolere en mutasjon eller lage et antistoff for å bekjempe et virus.

Prosessen med nick-translasjon innebærer det som blir referert til som restriksjonsenzymer som brukes til å lage kutt eller "nicks" på DNA-sekvensen. Et restriksjonsenzym er designet for å kutte en DNA-sekvens på et spesifikt sted og er en type forsvarsmekanisme som brukes til å ødelegge skadelige virus. Forskere legger begrensningsenzymet til å jobbe med å kutte biter av DNA slik at de kan erstatte dem med nye stykker.

Når nicks er laget, brukes spesifikke enzymer for å reparere DNA med spesielle nukleotider designet for å gjøre studiet av DNA enklere. Forskere studerer denne nye DNA-sekvensen for å se hvordan den reagerer på seg selv eller andre objekter, og å ha disse merkede nukleotidene forenkler prosessen med å overvåke og studere DNA-strengen nøye. Et vanlig eksempel er innsetting av merkede nukleotider som vil gløde når de plasseres under et svart lys, og dermed gjøre dem enkle å få øye på.

Et annet vanlig eksempel på en av de mange anvendelsene av nick-translasjon er fluorescerende in situ hybridisering. Denne prosessen lar en forsker se etter spesifikke DNA-sekvenser for å se om de er til stede i en DNA-streng. Nick-oversettelse kan gi disse strengene av DNA-lysstoffegenskaper, slik at de gløder, og forskeren kan bruke dette til å identifisere hvilke DNA-sekvenser som er til stede og hvilke som er fraværende.

Nukleotider fjernet og deretter erstattet gjennom nick-oversettelse betegnes ofte som "søppel-DNA." Forskere har ennå ikke klart å finne noen form for formål som disse DNA-molekylene tjener. De ser ut til å fungere og har ikke koden for noen form for protein, som er typisk for mest nyttig DNA.