Hva er et syklisk peptid?
Sykliske peptider er en uvanlig klasse av forbindelser som først ble oppdaget fra mikroorganismer på grunn av deres biologiske aktiviteter. De spenner fra antibiotika, som bacitracin og polymyxnB, til immunosuppressant medikament cyclosporine. De kan også være giftstoffer. Alfa-amanitin, giften fra dødshette-soppen, er også et syklisk peptid.
Disse forbindelsene gjennomgår veldig aktiv undersøkelse som potensielle nye kilder til medisiner og antibiotika. De er mye mer motstandsdyktige mot proteaser - enzymer som bryter ned proteiner - enn en lineær peptidkjede. Denne motstanden mot proteolyse betyr at de har en tendens til å overleve den menneskelige fordøyelsesprosessen. De kan også binde proteiner i cellen der tradisjonelle medisiner ikke kan.
De uvanlige egenskapene til sykliske peptider skyldes både deres sirkulære struktur og deres uvanlige modus for biosyntese, som ofte inkorporerer uvanlige forbindelser. Bortsett fra de 20 aminosyrene som vanligvis brukes i proteiner, kan 300 forskjellige naturlige forbindelser brukes til å syntetisere sykliske peptider. For eksempel kan de inneholde D-aminosyrer.
Som alle peptider består de av kjeder av aminosyrer bundet av en peptidbinding. De fleste peptider er lineære, med en N-ende med en aminogruppe i den ene enden, og en C-ende med en karboksylgruppe i den andre enden. I sykliske peptider er N- og C-endene koblet sammen, og danner en syklisk polypeptidkjede. Når det er færre enn 50 aminosyrer, er forbindelsen kjent som et syklisk peptid. En større forbindelse er kjent som et syklisk protein .
Det forskes mye på syntese av nye sykliske peptider. De kan syntetiseres ved hjelp av spesialiserte teknikker, kjent som peptidsyntese. Det er bioteknologiselskaper som spesialiserer seg på å lage tilpassede peptider for forskningsstudier. Sykliske peptider har vist løfte om behandling av Alzheimers og Huntingtons sykdommer. Etter hvert som mer informasjon blir tilgjengelig om deres interaksjon med cellulære proteiner, kan det være mulig å utvikle enda flere medisiner fra denne forskjellige klassen av forbindelser.
Bortsett fra den biologiske aktiviteten til sykliske peptider, er de av interesse som bærere . Dette betyr at de kan konstrueres for å frakte medikamenter inn i kroppen. Spesielt hvis stoffet er et peptid, kan det syntetiseres som en del av det sykliske peptidet og tas oralt.
Biosyntesen av naturlige sykliske peptider er interessant for biologer, siden den ofte involverer ikke-ribosomale peptidsyntetaser . De fleste peptider er laget av ribosomer, som bruker messenger RNA (mRNA) som mal og deretter monterer aminosyrene for å danne et peptid eller protein. Noen mikroorganismer har store enzymkomplekser sammensatt av moduler som de bruker for å sette sammen de sykliske peptidene. De bruker ikke ribosomer eller mRNA. I noen tilfeller er det mulig å endre modulene og genetisk konstruere det sykliske peptidet, eventuelt danne nye forbindelser med biologisk aktivitet.