Hva er en mikroarray?

En mikroarray er en sekvens av prikker av DNA, protein eller vev anordnet på en gruppe for enkel samtidig analyse. Den mest kjente er DNA-mikroarrayen, som spiller en integrert rolle i profilen av genuttrykk. Underlagsmaterialet er glass, plast eller en silisiumbrikke. Alternative navn for DNA-mikromatikken inkluderer genbrikke , DNA-brikke og biochip . De små bitene med DNA kalles sonder .

En mikroarray kan lages på mange forskjellige måter. Det mest primitive er å bare slippe DNAet på glassglassene ved hjelp av pinner. Mer sofistikerte teknikker bruker fotolitografi, elektrokjemiske tilnærminger og til og med blekkskriverutskrift - alt som kan levere DNA til et presist sted nøyaktig.

DNA-mikroarrayen er et produkt fra slutten av 1980-tallet og begynnelsen av 1990-tallet, da bioteknologi virkelig begynte å ta fart. Mikroarrayen lar en forsker utføre en sekvens av tester på alle prøvene samtidig, og påskynde forskningen dramatisk. Tradisjonell biologisk eksperimentering jobber med ting én om gangen. Probene er noen ganger merket med prikker kalt fluorofores når de ikke lett kan skilles fra hverandre.

Noen av de største mikroarrayene, laget av selskaper som NimbleGen Systems, inneholder så mange som 390 000 flekker. Mikroarray brukes ofte til å analysere hele genomet til en organisme, som kan inneholde dusinvis av kromosomer eller mer, hver med sitt eget DNA og RNA. Dessverre er ikke alle mikroarrayer kompatible med hverandre, og det er en tydelig mangel på standarder. Standardiseringsarbeid pågår, men uten så stor suksess som ennå.

I likhet med de fleste nyskapende agendaer for bioteknologi, kan tester på mikroarray produsere enorme mengder data, noe som gir opphav til feltet bioinformatikk , som prøver å gi mening om det hele. Det kan eksistere funn og korrelasjoner som vi allerede har målt, men ganske enkelt ikke lagt merke til på grunn av overflod av data. Data mining brukes mye til å analysere resultatene fra disse komplekse eksperimentene.