Hva er et mikrobielt genom?

Et mikrobielt genom er en komplett sekvens av en gitt mikrobes genetiske kode. Størrelsen på genomet i mikrober kan variere betydelig; den ferdige størrelsen på en organisme har ikke nødvendigvis betydning for størrelsen på dens genetiske kode. Mikrober har vært sammen i ekstremt lang tid, og som et resultat har mange veldig store og sammensatte genomer som har mye interessant historisk og genetisk informasjon.

Mikrober, også kjent som mikroorganismer, er levende organismer som er så små at de bare kan sees ved hjelp av mikroskopi. Noen eksempler på mikrober inkluderer grønne alger, bakterier, protister, archaea, plankton og noen sopp. Disse organismer varierer mye i kompleksitet, fra ekstremt enkle levende organismer til andre som er mye mer komplekse. Mikrober kan finnes overalt, og de har en rekke viktige biologiske funksjoner, alt fra å delta i nedbrytningen av organisk materiale til bærende sykdommer.

Genomet er det komplette settet av enhver organisms genetiske materiale. Når det gjelder et mikrobielt genom, består det av et fullstendig sekvensert sett med genetisk informasjon fra en mikrobe. Ved å fullstendig sekvensere det mikrobielle genomet, kan forskere lære mye mer om mikroben og hva den gjør. For eksempel kan de være i stand til å spore den evolusjonære historien til organismen, og se hvor den og andre avviket fra en felles stamfar. På samme måte kan forskere begynne å lære mer om de spesifikke funksjonene til noen DNA-sekvenser, og finne ut hvilke deler av genomet som gjør hva.

Med bakterier kompliseres sekvensering av det mikrobielle genomet ved at mange bakterier har plasmider. Et plasmid er et segment av DNA som ikke bæres på et kromosom. Dette ekstrakromosomale DNAet kan utveksles mellom bakterier, og kan noen ganger integreres i det mikrobielle genomet, avhengig av hvilken organisme som er involvert og hvilket miljøbelastning det blir utsatt for. Genanalyse av bakterier kan inkludere separat analyse for å identifisere plasmider.

Flere laboratorier over hele verden forsker på mikrobielle genomer. Flere regjeringer har satt opp gensekvenseringsprosjekter som er utviklet for å fremme kunnskap om mikrobielle genomer, delvis med mål om å utvikle vitenskapelig bruk av mikroorganismer. For eksempel har sekvensering av noen bakterier avslørt at de kan være nyttige i miljøopprydding, mens forståelsen av hvordan plasmider fungerer har ført til bruk av genmanipulerte plasmider som kan brukes til å sette genetisk materiale inn i andre organismer.