Hva er en peptidsekvens?

peptider er biologiske polymerer dannet ved kobling av aminosyrer, hvis viktige elementer er karbon (C), hydrogen (H), oksygen (O) og nitrogen (N). Begrepet "peptidsekvens" refererer til rekkefølgen aminosyrer er koblet sammen. Peptider er veldig viktige i levende systemer og kombineres for å danne mye større kjeder som kalles proteiner. Selv om det er mange varianter av biologiske peptider, består de fleste av disse fra bare 20 aminosyrer. Proteiner utfører en rekke biologiske funksjoner, inkludert som enzymer og i strukturen av cellevegger i planter og membraner i dyreceller.

aminosyrer er såkalt fordi de har amin (-Nh 2 ) og karboksylsyre (-co ₂ h) grupper. De fleste av aminosyrene som finnes i biologiske systemer har den generelle formelen R-CH (NH _{2 )-Co 2 H, hvor R er et utvalg av grupper. Den varierende strukturen til R er det som påvirker strukturen og egenskapene til peptider og proteiner.}

peptidsyntese skjerEn aminosyres amingruppe reagerer med karboksylsyregruppen på en annen aminosyre. Resultatet er dannelsen av en amidgruppe av struktur -n (h) -Co- der nitrogen-til-karbonbindingen kalles en peptidbinding. Reaksjonen kan skje et hvilket som helst antall ganger for å danne en peptidsekvens av forskjellige funksjonelle grupper, som hver er ispedd en amidgruppe.

peptider og proteiner har forskjellige nivåer av struktur. Primær proteinstruktur er rekkefølgen aminosyrene er funnet; Dette er peptidsekvensen. De funksjonelle gruppene på proteinet interagerer med hverandre for å trekke det i en form. De individuelle vendingene til et peptid kalles det sekundære strukturen. Den generelle formen, nettoresultatet av alle disse vendinger, er peptidens tertiære struktur.

De biokjemiske egenskapene til proteiner eller peptider avhenger av tertiær struktur. SomMed alle kjemikalier vil proteiner anta den mest energisk gunstige formen. Denne formen er på grunn av attraktive og frastøtende krefter mellom gruppene på de enkelte aminosyrene. Derfor er tertiær struktur på grunn av primærstruktur, noe som betyr at å trekke peptidsekvensen til et bestemt protein til slutt forklare dens egenskaper.

Å jobbe ut peptidsekvensen til et protein har anvendelser i utforming av legemidler. Mange biologiske prosesser er avhengige av virkningene av proteiner, og medisiner fungerer ofte ved å enten kopiere eller blokkere virkningen av disse proteiner. Å forstå atferden til proteiner kan føre til utforming av mer effektive medisiner. Av denne grunn har forsknings- og utviklingsavdelingen i et farmasøytisk selskap typisk et peptidbibliotek eller peptidkatalog som det vil bruke i jakten på nye medisiner.