Hva er et stoppkodon?

Et stoppkodon er en nukleinsyretriplett i messenger RNA (mRNA) som ikke koder for en aminosyre, og dermed stopper produksjonen av et protein. I hovedsak forteller stoppkodonet ribosomene som utfører mRNA-koden, at det er på tide å stoppe; man kunne tenke på det nesten som en perforert linje i et papirark som indikerer “rive her.” Uten et stoppkodon på plass, ville proteiner laget av RNA bestå av uendelige kjeder av aminosyrer, fordi ribosomene ikke ville vite når de skulle stoppe .

Stoppkodoner er også til stede i DNA, slik at de overføres når DNA blir transkribert til RNA. I DNA er de tre stoppkodonene TAA, TAG og TGA. Disse trillingene er "tullete" kodoner som ikke koder for noe, noe som reduserer risikoen for at det blir gjort en feil. Når de blir transkribert til RNA, er stoppkodonene UAA, UAG og UGA.

Lengden på en aminosyrekjede i et protein kan variere, noe som betyr at stoppkodoner blir funnet med varierende intervaller i koding av DNA og RNA, områdene i den genetiske koden som inneholder informasjon som må utføres for å lage proteiner. Stoppkodoner kan identifiseres når DNA sekvenseres, og kan brukes til å identifisere de spesifikke stedene i den genetiske koden som tilsvarer bestemte proteiner, og derved til spesiell genetisk informasjon.

Som med andre DNA-områder er det mulig for en mutasjon å vises i et stoppkodon. Kodonet kan bli transkribert feil, eller nukleinsyrer i kodonet kan byttes ut, og forårsake problemer når ribosomene går til å oversette mRNA for å bygge aminosyrekjeder. I en enkelt celle kan dette føre til en tilfeldig mutasjon som får cellen til å dø eller funksjonsfeil. Hvis det imidlertid oppstår feil i stoppkodonene i en bakteriecelle, og at kimcellen går sammen med en fra en annen organisme, vil den resulterende organismen ha en medfødt mutasjon, og i noen tilfeller kan mutasjonen være så alvorlig at organismen ikke kan leve .

Genetikere kan bruke sin kunnskap om stoppkodoner for å sortere informasjonen i en del av DNA eller RNA. Ved å lete etter stoppkodoner kan de identifisere spesifikke kjeder av aminosyrer og bestemme hvilke proteiner genetisk materiale koder for. Denne informasjonen kan brukes til å lære mer om hva den gjør, og hva som skjer når det går galt. Å finne et stoppkodon kan være nyttig når du studerer DNA og RNA for å lære mer om en mutasjon eller variasjon som er identifisert.