Hva er bioinformatikkanalyse?

"Bioinformatikkanalyse" er et begrep som brukes for å beskrive en rekke teknikker som bruker datastyrte systemer for å samle inn og analysere store organer med biologiske data. Bioinformatikk er en tverrfaglig tilnærming til biologiske problemer og innebærer ofte omfattende bruk av informatikk og matematikk i tillegg til de tradisjonelle biologiske og kjemiske tilnærmingene som ofte brukes til å konfrontere biologiske problemer. Mange av de sentrale teknikkene i bioinformatikkanalyse er basert på statistikk. De involverer å samle et stort antall data, vanligvis fra mange eksperimenter og noen ganger fra mange forskjellige laboratorier, og lete etter statistiske trender og betydelige korrelasjoner. Bruksområder for bioinformatisk analyse inkluderer DNA-sekvensanalyse, genuttrykk og reguleringsanalyse og sammenligninger av genomer fra forskjellige organismer.

Mange forskjellige teknikker brukes i bioinformatikkanalyse basert på de spesielle biologiske problemene som må løses. I noen tilfeller innebærer bioinformatikk ganske enkelt å samle store informasjonsmasser til en enkelt database og kjøre grunnleggende statistiske analyser av de innsamlede dataene. Andre involverer mye mer nyansert manipulering av innsamlet informasjon og kan innebære komplekse, matematisk involverte dataprogrammer. Det eneste de fleste metodene i bioinformatikk har til felles er at de involverer innsamling, manipulering og analyse av store informasjonsmasser samlet under eksperimenter.

En av de viktigste bruksområdene for bioinformatikkanalyse er å analysere sekvenser av tråder av deoksyribonukleinsyre (DNA). DNA-molekyler inneholder den genetiske koden som styrer strukturen og funksjonen til alle organismer. Mens manuelle tidlige manuelle sekvenseringsmetoder ble brukt, var de veldig trege og helt umulige for storskala sekvenseringsprosjekter. Bioinformatikkanalyseteknologi muliggjør veldig rask sekvensering som er mange ganger raskere enn manuell sekvensering og som er egnet for store prosjekter. DNA-sekvensering, så vel som ribonukleinsyre (RNA) -sekvensering og proteinsekvensering, kan brukes til å koble forskjellige strukturer og funksjoner til deres genetiske koder, for å identifisere mutasjoner og for å sammenligne genomene til forskjellige organismer.

Automatisering er et av hovedmålene for bioinformatikkanalyse. Det er mange forskjellige situasjoner i biologisk og biomedisinsk forskning som involverer analyse av store informasjonsmasser. Selv om det vanligvis er mulig å analysere den informasjonen manuelt, er det ofte så mye informasjon at en enkelt lab kan jobbe i flere uker eller lenger for å gi mening om relativt små informasjonsmasser. Bioinformatikkanalyse kan brukes til å analysere informasjonen slik at forskerne kan bruke tiden sin på å generere mer data. Evnen til å analysere mer data kan resultere i mer nøyaktig, overbevisende og betydelig informasjon.