Hva er Proteomics?

Studiet av det menneskelige genomet er et spennende og ofte omtalte forskningsfelt. Studien av det menneskelige proteomet, alle de forskjellige proteiner som danner menneskekroppen, er mindre kjent, men like spennende og viktig. Begrepet proteomikk ble myntet for å beskrive denne fascinerende og komplekse vitenskapen.

Proteomics er studiet av alle proteiner som utgjør en organisme. Proteomics studerer ikke bare proteinene i seg selv, men også hvordan de interagerer, endringene de gjennomgår, og effektene de har i organismen. Størrelsen og kompleksiteten til det menneskelige proteomet er en del av det som gjør proteomikk til en veldig kompleks vitenskap.

Akkurat som genomikk starter med en kartlegging av det menneskelige genom, prøver proteomikk å identifisere og evaluere funksjonen til alle de forskjellige proteiner i menneskekroppen. Dette er en skremmende oppgave, fordi det ikke bare er et stort antall proteiner i det menneskelige proteomet, omtrent 400 000; men disse proteinene forekommer også forskjellige steder i kroppen på forskjellige stadier i en persons liv, og kan endres i en enkelt celle. Det er en rekke forskjellige metoder tilgjengelig for proteomikkforskere for å studere proteiner. Ulike typer røntgenmaskiner er i stand til å gi proteomics-forskere detaljer om strukturen til proteiner. Røntgen- og magnetisk resonansimaging (MRI) maskiner lar også proteomikkforskere se hvor proteinene forekommer i kroppen og i individuelle celler.

Proteomikkforskere er også avhengige av affinitetskromatograf og gelelektroforese for å studere individuelle proteiner. Begge metodene gir proteomikkforskeren informasjon om de fysiske dimensjonene til proteinene. Gelelektroforese skiller forskjellige proteiner ut fra deres størrelse ved å bruke en elektrisk strøm for å bevege dem gjennom en gel. De større proteiner beveger seg saktere, så på en bestemt tid er proteinene som har beveget seg den korteste avstanden større enn de som har beveget seg lenger.

Affinitetskromatografen forteller proteomikkforskere hvilke kjemikalier eller andre proteiner et spesifikt protein interagerer med. Affinitetskromatorafen kan felle spesifikke stoffer, slik at proteomikkforskeren kan vaske bort uønsket materiale. Ved å fange et spesifikt protein, kan forskere skille det andre materialet, inkludert kjemikaliene eller andre proteiner som målproteinet interagerer med.

Proteomikk er fremdeles et relativt nytt felt, og som du ser er det ganske sammensatt. Forskere som forsker på proteomikk har muligheten til å oppdage utildret informasjon om det menneskelige proteomet. Bare fremtiden vil fortelle oss hva vitenskapelige og medisinske fremskritt proteomics kan føre til.