Co to są Pseudogenes?
Pseudogeny to fragmenty DNA, które wyglądają jak geny, ale nie zachowują się jak geny, ponieważ nie są w stanie dokonać transkrypcji. Transkrypcja jest pierwszym etapem ekspresji genów, a jeśli segment DNA nie jest w stanie przeprowadzić transkrypcji, jest niefunkcjonalny. Ponieważ pseudogeny są niefunkcjonalne, niektórzy ludzie zbijają je w tak zwane „śmieciowe DNA”, które nie pełnią żadnej funkcji, ale ponieważ posiadają pewne cechy związane z genami, mają duże znaczenie naukowe. Innymi słowy to, że nie działają, nie oznacza, że nie mają nic do powiedzenia.
Kilka procesów może spowodować powstanie pseudogenu. Czasami mutacja powoduje, że gen staje się nieaktywny, uszkadzając DNA, tak że nie jest już zdolny do transkrypcji, a mutację można przekazać i amplifikować w niektórych populacjach. Te pseudogeny są znane jako „niepełnosprawne”. Jeśli wystarczająca część populacji ma mutację, ostatecznie gen przestanie ekspresjonować w tej populacji, powodując zanik określonej cechy genetycznej.
Można również przetwarzać pseudogeny, będące wynikiem mRNA, który retrotranspozuje do DNA, a następnie wstawia się do DNA. Segment DNA będzie niefunkcjonalny, ale może wyglądać jak kompletny gen. Nieprzetworzone pseudogeny występują, gdy geny się replikują, a jedna z replik przestaje działać z powodu mutacji. Z biegiem pokoleń DNA będzie stopniowo rozkładać się jeszcze bardziej, ostatecznie przekształcając się w prawdziwe śmieciowe DNA.
Głównym powodem zainteresowania pseudogenów jest to, że mogą one odzwierciedlać zmiany ewolucyjne i ujawniać informacje o związkach między różnymi organizmami. Na przykład dwa gatunki dużych kotów można prześledzić do wspólnych przodków za pomocą pseudogenów, a badacze szukają podobnych długości materiału genetycznego, aby ustalić, kiedy gatunek zaczął się odrywać. Pseudogenów można również użyć do wymiany historii ewolucji organizmu, a naukowcy szukają nieaktywnych genów kodujących cechy, które już się nie pojawiają. Pseudogeny można porównać do informacji zakodowanych na stronie filmu; nie widać tego na gotowym zdjęciu, ale zapewnia cenne informacje dla tych, którzy wiedzą, gdzie szukać.
Z definicji ten materiał genetyczny jest niefunkcjonalny. Wiadomo jednak, że występuje aktywacja pseudogenu, najczęściej w nowotworach złośliwych, gdzie coś wyzwala aktywację nieistniejącego genu. Naukowcy zauważyli, że pseudogeny są czasami zaangażowane w rozwój niektórych nowotworów, przez co proces aktywacji jest interesujący dla osób pracujących w leczeniu raka i profilaktyce.