Co to jest biblioteka genomowa?
Biblioteka genomowa to zbiór bakterii, które zostały genetycznie zmodyfikowane tak, aby utrzymywały całe DNA organizmu. Wielkość biblioteki jest różna, w zależności od tego, jak DNA jest przechowywane w bakteriach i długości genomu organizmu. Biblioteki genomowe są wykorzystywane w badaniach genetycznych na całym świecie w różnych obiektach laboratoryjnych. Firmy produkujące biblioteki genomowe mogą je udostępniać naukowcom na specjalne zamówienie.
Składanie biblioteki genomowej rozpoczyna się od traktowania DNA badanego organizmu, tak aby rozpadł się na porcje, które są uporządkowane według długości, a następnie wstawione do wektorów do klonowania, takich jak plazmidy. Różne wektory mogą przechowywać różne ilości DNA. Po wstawieniu DNA wektor można wprowadzić do bakterii. Zbiór bakterii zawiera pełny genom organizmu.
Po utworzeniu biblioteki genomowej badacze mogą z nią pracować na wiele różnych sposobów. Na przykład mogą wyszukiwać określone łańcuchy DNA w bibliotece za pomocą sond zaprojektowanych do identyfikacji i znakowania określonych sekwencji aminokwasowych. Za pomocą sondy można izolować sekwencje do dalszych badań i analiz, aby dowiedzieć się więcej o poszczególnych obszarach zainteresowania genomu. Bibliotekę genomową można również przechowywać w stanie zamrożonym do wykorzystania w przyszłości. Tak długo, jak jest przechowywany w stabilnych warunkach, może trwać bardzo długo.
Korzystając z biblioteki genomowej, badacze mogą badać genom organizmu, aby dowiedzieć się więcej na temat struktury i funkcji genomu. Mogą także mapować genom, identyfikując lokalizacje określonych genów. Informacje te stają się niezwykle przydatne, gdy naukowcy chcą opracować testy, które mogą być wykorzystane do zlokalizowania odmian genetycznych, w tym mutacji, które mogą być związane z warunkami wrodzonymi. Im głębsze zrozumienie genomu organizmu, tym więcej badaczy może wiedzieć o całym organizmie.
Bibliotekę genomową można również wykorzystać do klonowania segmentów DNA. Wektory bakterii gospodarza mogą być replikowane przez gospodarza w celu utworzenia wielu kopii interesującego segmentu, przy czym kopie te są dalej badane lub wstawiane do innych wektorów w celu modyfikacji genetycznej i innych celów badawczych. Na przykład sklonowane materiały można wprowadzić do upraw w celu wprowadzenia określonych modyfikacji w celu poprawy wydajności upraw.