Co to jest Kilobase?

Kilobaza jest miarą numeracji stosowaną w dziedzinie genetyki. Ponieważ baza jest jednym z elementów składowych informacji genetycznej, a każdy organizm zawiera wiele zasad, 1000 zasad to wspólna liczba do wykorzystania przy omawianiu, ile zasad zawiera biblioteka genetyczna organizmu. Ta 1000 bazowa porcja jest lepiej nazywana kilobazą.

Każdy żywy organizm zawiera informacje genetyczne. Ta informacja określa organizm, które produkty białkowe organizm potrzebuje do życia, wzrostu i namnażania. Cała informacja genetyczna razem nazywa się genomem organizmu.

Każdy genom jest podzielony na odrębne sekcje. Te sekcje, zwane genami, kodują konkretny produkt. Każdy gen zawiera ciąg bloków budulcowych, zwanych zasadami. Kiedy organizm odczytuje geny w celu wytworzenia określonego produktu, odczytuje sekwencję zasad w genie.

W DNA materiału genetycznego istnieją tylko cztery zasady. Są to cytozyna (C), guanina (G), tymina (T) i adenina (A). Kolejność, w jakiej zasady są ułożone w genie, decyduje o tym, co koduje ten gen. Złożoność niezbędna do wytworzenia wszystkich produktów niezbędnych dla ludzkiego życia wynika z długości genów i liczby zawartych w nich zasad.

Każdy z genów zawiera niezwykłą liczbę zasad. Na przykład cały ludzki genom zawiera 3 miliardy zasad, z których każda jest sparowana z inną bazą w spiralnej strukturze helisy. Sama ilość zasad obecnych w genomie oznacza, że ​​genetykom łatwiej jest odnosić się do genów o długości x kilobaz, w przeciwieństwie do 1000 razy x długości.

Nawet najmniejszy genom, taki jak genom bakterii Carsonella ruddii , ma około 160 000 par zasad. Ten malutki genom ma około 160 kilobaz (kb) długości. Z drugiej strony ludzki genom ma długość 3 milionów par zasad.

Sekwencjonowanie genomów wymaga najpierw rozbicia genomu. Sprzęt, który wykonuje sekwencjonowanie, może obsłużyć tylko tyle baz jednocześnie. Genetycy mogą podzielić genom na wiele sekcji i nazywać je tak, że zawierają tak wiele par kilobaz, na przykład o długości 150 par baz. Ten rozmiar materiału genetycznego może zostać genetycznie zmodyfikowany w innym organizmie w celu pomnożenia DNA do poziomu, który jest łatwy do odczytania. Nawet te stosunkowo małe fragmenty DNA są zbyt długie do bezpośredniego sekwencjonowania, więc genetycy mogą następnie rozbić segment o wielkości 150 kb na znacznie mniejsze części o długości kilkuset zasad.