Co to jest marker masy cząsteczkowej?
Marker masy cząsteczkowej jest cząsteczką stosowaną do oszacowania wielkości cząsteczek poddanych elektroforezie żelowej. Jest to technika, w której DNA, RNA lub białka są oddzielone wielkości, przy użyciu prądu elektrycznego na żelu. Termin ten nie należy mylić z markerami molekularnymi w genetyce - obszary, w których DNA organizmu różni się od reszty populacji i można go zidentyfikować z sondy DNA.
Markery masy cząsteczkowej białka są powszechnie stosowane, gdy białka są oddzielone elektroforezy żelowe. Marker masy cząsteczkowej to grupa białek o znanej masie cząsteczkowej, które są ogólnie dostarczane przez firmy biotechnologiczne w określonym zakresie wielkości. Wybiera zakres wielkości na podstawie badanych próbek. Markery masy cząsteczkowej są ładowane razem i oddzielone podczas biegu. Mierząc odległość przebywającą przez markery i interesujące białko, można określić wielkość białka eksperymentalnego.
PES markerów można wizualizować w różnych manierach. Niektóre markery molekularne są nieznakowane i są wybarwione w żelu z resztą białek. Nie są widoczne, dopóki cały żel nie zostanie zabarwiony. Inne rodzaje markerów molekularnych białka są wstępnie zabarwione kolorami, a każdy rodzaj białka ma inny kolor. Separacja jest widoczna, gdy żel działa.
Jedną zaletą wcześniej barwionego markera masy cząsteczkowej jest Western blot. Jest to technika, w której białka są przenoszone na błonę, a następnie wybarwione przeciwciałami w celu wykrycia określonego białka. Kolorowe markery pomaga ustalić, czy przeniesienie białek jest zakończone, zanim przejdzie się z resztą procedury.
Markery masy cząsteczkowej są powszechnie stosowane do analizy DNA na żelach. Często markery molekularne DNA są wykonane z wirusa bakteryjnego Lambda . OgraniczenieME są wytwarzane przez bakterie w celu strawienia DNA organizmów atakujących, a enzym ogranicznika hindIII jest często stosowany do degradacji DNA Lambda. Produkuje serię różnych, powtarzalnych fragmentów znanych jako drabina DNA . Porównując odległość prowadzoną przez standardy w skali logarytmicznej, można określić wielkość analizowanych fragmentów DNA.
Ten marker masy cząsteczkowej DNA można zastosować do analizy wielkości DNA wytwarzanego podczas izolacji genów i w eksperymentach inżynierii genetycznej. Można go również stosować podczas reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), w której niewielkie ilości DNA lub RNA są amplifikowane w celu uzyskania dużych ilości produktu. Techniki PCR są powszechnie związane z badaniami ojcostwa i nauk sądowych, ale są również bardzo powszechne w badaniach medycznych i podstawowych biologicznych. Specjalne markery masy cząsteczkowej są dostępne dla mniejszych produktów wytwarzanych z niektórych rodzajów PCR lub małych cząsteczek RNA.