Co to jest sekwencja peptydowa?

Peptydy są polimerami biologicznymi utworzonymi przez łączenie aminokwasów, których kluczowymi elementami są węgiel (C), wodór (H), tlen (O) i azot (N). Termin „sekwencja peptydowa” odnosi się do kolejności połączenia aminokwasów. Peptydy są bardzo ważne w systemach żywych i łączą się, tworząc znacznie większe łańcuchy zwane białkami. Chociaż istnieje wiele odmian peptydów biologicznych, większość z nich składa się z zaledwie 20 aminokwasów. Białka wykonują szereg funkcji biologicznych, w tym jako enzymy i w strukturze ścian komórkowych w roślinach i błonach w komórkach zwierzęcych.

aminokwasy są tak nazywane, ponieważ mają aminę (-NH ) i kwas karboksylowy (-cco 2 h). Większość aminokwasów znalezionych w układach biologicznych ma ogólną formułę R-CH (NH _{2 )-CO 2 H, gdzie R jest zakresem grup. Zmieniająca się struktura R wpływa na strukturę i właściwości peptydów i białek.}

Synteza peptydów występuje WHEN grupa aminowa jednego aminokwasu reaguje z grupą kwasu karboksylowego na innym aminokwasie. Rezultatem jest tworzenie grupy amidowej struktury -N (H) -CO-, w której wiązanie azot-węglowe nazywa się wiązaniem peptydowym. Reakcja może mieć miejsce dowolne razy, aby utworzyć sekwencję peptydową różnych grup funkcjonalnych, z których każda jest przeplatana przez grupę amidową.

Peptydy i białka mają różne poziomy struktury. Pierwotna struktura białka to kolejność, w której znajdują się aminokwasy; To jest jego sekwencja peptydowa. Grupy funkcjonalne na białku oddziałują ze sobą, aby wciągnąć go w kształt. Indywidualne zwroty akcji i zakręty peptydu nazywane są jego wtórną strukturą. Jego ogólnym kształtem, wynikiem netto wszystkich tych zwrotów i zakrętów, jest struktura trzeciorzędowa peptydu.

Właściwości biochemiczne białek lub peptydów zależą od struktury trzeciorzędowej. JakW przypadku wszystkich chemikaliów białka przyjmą najbardziej sprzyjający kształt energetycznie. Ten kształt wynika z atrakcyjnych i odpychających sił między grupami na poszczególnych aminokwasach. Dlatego struktura trzeciorzędowa wynika ze struktury pierwotnej, co oznacza, że ​​odstukanie sekwencji peptydowej określonego białka ostatecznie wyjaśni jego właściwości.

Opracowywanie sekwencji peptydowej białka ma zastosowanie w projektowaniu farmaceutyków. Wiele procesów biologicznych zależy od działania białek, a leki często działają poprzez kopiowanie lub blokowanie działania tych białek. Zrozumienie zachowania białek może prowadzić do zaprojektowania bardziej skutecznych leków. Z tego powodu dział badań i rozwoju firmy farmaceutycznej zazwyczaj ma bibliotekę peptydową lub katalog peptydowy, który będzie stosował w poszukiwaniu nowych leków.