Co to jest ramka do czytania?
Ramka odczytu to sekwencja informacji genetycznej, która zawiera dane, które można wykorzystać do kodowania aminokwasów, które można połączyć w łańcuchy polipeptydowe w celu wytworzenia białek. Ramki odczytu znajdują się zarówno w DNA, jak i RNA. Naukowcy mogą badać ramki do czytania, aby dowiedzieć się więcej o określonych genach i procesach, które mogą zakłócać ekspresję genów.
W przypadku DNA, DNA zawiera zestawy nukleotydów zwanych trojaczkami lub kodonami. Każdy kodon może być transkrybowany przez RNA na inny triplet, a z kolei przetłumaczony na aminokwas. System ten jest wykorzystywany przez każdy żywy organizm na Ziemi do kodowania informacji genetycznej. Genom organizmu, kompletny zbiór informacji genetycznej, który zawiera, zawiera instrukcje dotyczące wszystkiego, od tego ile kończyn ma rosnąć w macicy, w przypadku ssaków, po plany, które można wykorzystać do zastąpienia komórek po ich śmierci.
Ramka odczytu to sekcja DNA lub RNA, która zawiera wskazówki dotyczące tworzenia kompletnego białka. W DNA istnieje sześć potencjalnych ramek odczytu, ponieważ początek ramki odczytu zależy od tego, gdzie zaczyna się czytanie, a DNA jest dwuniciowy. W przypadku RNA istnieją trzy potencjalne ramki odczytu. Ważne jest, aby określić właściwy punkt początkowy, ponieważ w przeciwnym razie ramka odczytu będzie transkrybować i tłumaczyć jako bełkot. Patrząc na ramkę odczytu, badacz może sprawdzić, które białko ma być kodowane przez grupę kodonów.
Jak można sobie wyobrazić, wstawianie lub usuwanie kodonów stanowi problem. Tak jak ktoś myli się podczas czytania książki z wyciągniętą stroną lub wstawionym losowym akapitem, ekspresja informacji genetycznej staje się mylona, gdy zmienia się ramkę odczytu. W rezultacie gen może nie wyrażać się zgodnie z oczekiwaniami, a ludzie mogą rozwinąć wrodzone nieprawidłowości. Jest to jeden ze sposobów, w jaki ludzie mogą doświadczać nieprawidłowości genetycznych.
W otwartej ramce odczytu można zidentyfikować wyraźne kodony start i stop. Otwarta ramka odczytu może zawierać pełny gen lub nakładające się geny; kod genetyczny nie zawsze jest tak uporządkowany, jak można sobie wyobrazić. W rzeczywistości kod genetyczny zawiera wiele tak zwanego niekodującego DNA, co oznacza, że DNA nie wydaje się pełnić funkcji pod względem ekspresji genów. Niekodujące DNA może zawierać interesujące informacje o dziedzictwie genetycznym gatunku i może pełnić inne funkcje, które z czasem zostaną odkryte, gdy naukowcy dowiedzą się więcej o genomie.