Co to jest jednostka transkrypcyjna?
Transkrypcja to proces zachodzący we wszystkich żywych komórkach. Podczas transkrypcji tworzone są nici RNA na podstawie DNA znalezionego w komórkach. Kiedy tworzona jest nić informacyjnego RNA (mRNA), jest ona następnie wykorzystywana do wytwarzania białek podczas translacji. Cała nić DNA zwykle nie jest transkrybowana do mRNA, ale zamiast tego są określone sekcje DNA, które są nazywane jednostkami transkrypcyjnymi.
W obrębie nici DNA znajdujących się w komórkach znajdują się sekwencje nukleotydów, które kodują początek i koniec. Enzymy przeprowadzające transkrypcję używają tych kodów do rozpoczynania i kończenia produkcji nici RNA. Jednostka transkrypcyjna to łańcuch nukleotydów w nici DNA, który zaczyna się od kodu początkowego i przechodzi do kodu końcowego.
Odnosząc się do odcinka DNA, który jest transkrybowany do RNA, wielu naukowców używa terminu „jednostka transkrypcyjna” zamiast „gen”. Ta zmiana terminologii nastąpiła, ponieważ badania wykazały, że transkrybowany DNA zawiera wiele dodatkowych nukleotydów, które nie są wykorzystywane do tworzenia białka. Sekcje DNA, które nie są używane do kodowania białka, nazywane są intronami, a sekcje, które kodują białko, nazywane są eksonami.
Często w łańcuchu DNA znajduje się znacznie więcej niekodujących intronów niż eksonów. Gen jest terminem używanym do opisania sekwencji nukleotydów DNA, która koduje białko. Uważano, że był ciągły, ale badania wykazały, że geny nie są ciągłymi niciami, ale są rozbite na eksony w całej jednostce transkrypcji DNA.
Jednostka transkrypcyjna zawiera zarówno introny, jak i eksony, które są kodowane do RNA przez enzym polimerazę RNA. Po wytworzeniu nici mRNA i zanim zostanie ona przekształcona w białko, introny są usuwane z RNA. Łączenie wycina introny z nici mRNA, a następnie łączy pozostałe części razem, tworząc końcową nić, która zostanie wykorzystana do translacji.
Końcowa nić mRNA utworzona po wystąpieniu splicingu może nie zawsze być taka sama. Alternatywne splicing odnosi się do faktu, że te same introny można usunąć z nici mRNA, ale eksony mogą łączyć się na różne sposoby. Oznacza to, że pojedyncza jednostka transkrypcyjna może w rzeczywistości kodować różne białka, ze względu na fakt, że końcowa sekwencja nici mRNA może być różna w zależności od tego, jakie egzony są połączone i w jakiej kolejności.