Co to jest transkryptom?
Transkryptom jest pełnym zbiorem RNA z organizmu, grupy komórek, a nawet specyficznej komórki. RNA jest syntetyzowany z DNA poprzez proces znany jako transkrypcja. RNA obecny w komórce i ciała określa, które geny będą wyrażane, i zmienia się w trakcie życia organizmu, w przeciwieństwie do DNA, który pozostaje statyczny. Presja środowiska jest jednym z wiodących powodów zmian, ponieważ ciało próbuje dostosować się do zmieniających się sytuacji środowiskowych, aby się działać.
Transkryptom jest znacznie mniejszy niż genom organizmu, pełne zbiór DNA w organizmie. Mówiąc prosto, można pomyśleć o DNA jako o książce kucharskiej, wymieniając pełną kolekcję przepisów, które można wykonać. Transkryptom jest kodem, który określa, które przepisy zostaną wykonane i kiedy. Książka kucharska pozostaje statyczna przez całe życie, podczas gdy transkryptom zmienia się w odpowiedzi na czynniki środowiskowe.
Jedna ważna część transkryptomuE jest cząsteczkami mRNA. Messenger RNA to RNA, który komunikuje się z rybosomami w komórkach, aby kierować komórkami, aby wytwarzać różne białka. Białka te są używane do szerokiej gamy funkcji. Inne części mogą nie bezpośrednio kodować produkcji białka, ale robią takie rzeczy, jak określanie struktury komórki i regulacja ekspresji genów. Razem różne elementy transkryptomu utrzymują organizm i określa ekspresję genów w tym organizmie.
W różnych komórkach w ciele transkryptom może być bardzo inny. Na przykład komórki wątroby mają RNA, co czyni je komórek wątroby i zapewnia, że komórki wykonują niezbędne funkcje. Z drugiej strony komórki skóry mają inny transkryptom, który aktywuje geny niezbędne do uczynienia komórki komórek skóry. Zarówno komórki wątroby, jak i skóry mają pełną kopię genomu, ale ich transkryptomy określają, które częściGenom jest aktywowany.
Podobnie jak w przypadku DNA, możliwe jest sekwencjonowanie RNA. Można zrobić sekwencjonowanie transkryptomu, aby dowiedzieć się więcej o działaniu komórki i DNA organizmu gospodarza oraz w celu zidentyfikowania miejsc, w których ekspresja informacji genetycznych zmierza. Na przykład, gdy komórka wątroby staje się złośliwa, dzieje się tak, ponieważ transkryptom nie działa tak, jak powinien, a geny nowotworów złośliwych stały się aktywowane lub w pewnym sensie komórki nie mają regulacji, powodując, że wymknęły się spod kontroli. Sekwencjonowanie RNA w złośliwej komórce może pomóc badaczowi dowiedzieć się, który gen został aktywowany lub inaktywowany, aby spowodować złośliwość.