Co to jest DNA Precipitation?
Wytrącanie kwasu dezoksyrybonukleinowego (DNA) jest kluczowym krokiem w izolacji i oczyszczaniu materiału genetycznego w nauce. Zasadniczo próbka tkanki biologicznej zawiera DNA lub RNA wraz z resztą organizmu. Aby przetestować DNA, naukowiec musi oddzielić DNA od wszystkich innych substancji. Wytrącanie DNA odnosi się w szczególności do etapu polegającego na oddzieleniu rozpuszczonego DNA od cieczy, w której jest rozpuszczony. Typowe metody precypitacji DNA obejmują dodanie etanolu, izopropanolu lub glikogenu do cieczy, co powoduje, że DNA zestala się w grudkach i spada do dno próbki cieczy.
Początkowe etapy oczyszczania DNA z próbki mogą być tak proste, jak kruszenie liści w misce w celu rozbicia części struktury. Następnie zacier można rozbić chemikaliami lub enzymami, które pozostawiają nienaruszone DNA. Zazwyczaj genetycy używają wirówki, aby pomóc rozdzielić różne składniki próbki. Jest to maszyna, która obraca próbkę, dzięki czemu najcięższy element opada na dno, a najlżejszy unosi się na górę.
Po usunięciu różnych niechcianych składników genetykowi zwykle pozostawia się klarowną ciecz, która zawiera materiał genetyczny. Następnie musi wyjąć DNA rozpuszczone w tej cieczy i odrzucić ciecz i inne substancje w cieczy. Wytrącanie DNA jest sposobem na osiągnięcie tego. Najczęściej naukowiec musi dodać substancję chemiczną do cieczy, aby wytrącić DNA.
Etanol lub izopropanol, które są formami alkoholu i należą do grupy rozpuszczalników chemikaliów, są najczęstszymi chemikaliami stosowanymi do wytrącania DNA. Glikogen to kolejna substancja, która może wytrącać DNA, ale jest rzadziej stosowana, oprócz wytrącania niskich stężeń materiału genetycznego. Kiedy te substancje chemiczne mieszają się z rozpuszczonym DNA, ich chemia pozwala im zmienić sposób, w jaki DNA wpasowuje się w jego środowisko. Podczas gdy wcześniej DNA łatwo miesza się z cieczą, po dodaniu substancji chemicznej przestaje wiązać się z cieczą i zamiast tego formuje się w ciało stałe.
To ciało stałe jest zwykle białawe i zlepia się ze sobą. Ponieważ część ciała stałego jest nadal w małych cząstkach, naukowiec zwykle umieszcza próbkę w wirówce, aby wszystkie cząstki stałe razem zebrać w granulkę na dnie probówki z próbką. Jest to oczyszczona forma DNA pierwotnie obecna w próbce, która jest przydatna do testowania. Zasadniczo ciecz, w której zawieszony jest granulat, jest usuwana z tubki, i granulka może być również suszona, aby umożliwić odparowanie chemikaliów, w celu uczynienia granulki tak czystym, jak to możliwe.