Co to jest adnotacja genomu?
Tagowanie genomu taguje sekcje genomu z informacjami o danych genetycznych, które zawiera. Jest to część procesu w Genome Projects, w której celem nie jest tylko sekwencjonowanie DNA docelowego organizmu, ale także zrozumienie, co robi i jak funkcjonuje. Naukowcy mogą przeprowadzać adnotację w swoich laboratoriach i mogą udostępniać dane innym naukowcom w celu gromadzenia zasobów i informacji. Dostępne są internetowe bazy danych otwarte dla publiczności, a niektórzy pozwalają członkom ogółu społeczeństwa na przesłanie własnych adnotacji.
Pierwszym krokiem w adnotacji genomu jest sekwencjonowanie, w którym naukowcy określają kolejność aminokwasów w DNA organizmu. Sekwencjonowanie całego genomu zajmuje dużo czasu i często zaczyna się adnotacjami przed dekodowaniem genomu. Z sekcją zsekwencjonowanego DNA w ręku badacz może zacząć adnotację. Naukowcy mogą zauważyć, gdzie geny wydają się zaczynają i zatrzymują, zwracając uwagę na charakterystyczne struny DNA, które zawierają informacjeO funkcji genomu. Komputery
są w stanie samodzielnie wykonać adnotację genomu. Mogą uwzględniać znane wzory, takie jak struny aminokwasów, które pojawiają się na początku i na końcu genów. W zautomatyzowanej adnotacji komputer może dodawać notatki do różnych sekcji serii DNA, aby dostarczyć informacji na ten temat. Możliwe jest również porównanie segmentów z różnych organizmów w celu poszukiwania wariancji, która może dostarczyć ważnych informacji o gatunku jako całości.
Ręczne adnotacja genomu polega na fizycznym przejrzeniu DNA. Wielu badaczy używa komputerów do wyświetlania informacji i oznaczania ich, umożliwiając im wprowadzenie ich do baz danych podczas ich pracy. W niektórych przypadkach recenzja ręczna może być konieczna po zautomatyzowanej adnotacji, aby upewnić się, że komputer poprawił informacje. Może to być żmudny proces i wystąpią błędy, co jest jednym z powodów.Chers lubią łączyć bazy danych. Jeśli adnotacja nie pasuje do innych w tej samej części DNA, ludzie mogą ocenić informacje, aby ustalić, co się stało, i naprawić błąd.
Nie zawsze jest możliwe ustalenie, co robi gen podczas procesu adnotacji genomu. Naukowcy mogą oznaczać geny i oddzielić je od innych składników genomu, takich jak niekodujące DNA, takie jak powtórzenia. Informacje te można wykorzystać w badaniach, ponieważ ludzie rozwijają teorie o różnych segmentach genomu. Mogą dodać do adnotacji, aby zwrócić uwagę na funkcję genu.