Co to jest pudełko Tata?

W żywych organizmach transkrypcja kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA) jest początkowym krokiem niezbędnym do ekspresji genu. Pudełko Tata, znane również jako Goldberg-Hogness Box, jest regionem DNA, który pomaga zainicjować proces transkrypcji. Jest częścią regionu promotora, który reguluje ekspresję genów poprzez zapewnienie miejsca wiązania enzymów zaangażowanych w transkrypcję genów. Pudełko TATA znajduje się w eukariotach-organizmach, które mają złożone struktury związane z błoną w ich komórkach-w tym ludzi.

DNA składa się z nukleotydów, powtarzających się jednostek strukturalnych, które są dostępne w czterech odmianach: nukleobaz adenina (A), tymina (T), guaniny (G) i cytozyny (C). Jak powtarzają te podstawy, tworzą wzorce, które kodują informacje genetyczne. Tworzą również pary poprzez wiązanie chemiczne w sposób uzupełniający się, a adenina przyczepiła się do tyminy i guaniny przyczepiają się do cytozyny. Pary zasad łączą dwie nici cząsteczki DNA do struktury podwójnej helisyRe.

Po transkrypcji DNA enzymy podzielone podwójną helisę na jej składowe wątki, odsłaniając kod genetyczny do powielania. Każda nici DNA jest używane jako szablon do syntezy nici kwasu rybonukleinowego (RNA). Enzym znany jako polimeraza RNA konstruuje łańcuch RNA przez wiązanie komplementarnych nukleobaz z każdą odsłoniętą nicią DNA.

Aby przepisywać pełne geny do przekaźnika RNA (mRNA) w celu ewentualnej ekspresji, polimeraza RNA musi rozpocząć transkrypcję we właściwym punkcie sekwencji DNA. Ten punkt, znany jako miejsce inicjacji, jest wskazywany przez region promotora, który występuje nieco powyżej genu. Pudełko Tata jest sekwencją DNA, składającą się z nukleobaz Tataaa, zlokalizowanej w regionie promotora około 25 par zasad przed miejscem transkrypcji.

Białka

znane jako czynniki transkrypcyjne wiążą się z skrzynką Tata. Jeden z nich, tata-białko wiążące (TBP), jest specyficzne dla TATA, podczas gdy inne mogą być w stanie wiązać się z regionami promotora innych niż TATA. Polimeraza RNA jest w stanie rozpoznać obecność czynników transkrypcyjnych jako sygnału do wiązania się z tą lokalizacją. Po wiązaniu z skrzynką TATA polimeraza RNA jest w miejscu inicjacji i może teraz zacząć transkrybować gen.

Większość regionów promotorów genów nie zawiera skrzynki Tata. W genach bez TATA czynniki transkrypcyjne rozpoznają inne sekwencje promotora i polimeraza RNA wiąże się z nimi. Naukowcy odkryli różnice w regulacji między genami z pudełkiem TATA i bez pudełka Tata poprzez badanie organizmów modelowych, takich jak Saccharomyces drożdże i mucha owocowa Drosophila .