Co to jest całkowity RNA?
Kwas rybonukleinowy (RNA) jest polimerem zaangażowanym w syntezę białek, replikację genów i replikację kwasu dezoksyrybonukleinowego (DNA). Polimer to cząsteczka zbudowana z łańcuchów liniowych, więc RNA jest łańcuchem liniowym zbudowanym z rybonukleotydów. Każda cząsteczka rybonukleotydowa składa się z zasady azotowej z grupą fosforanową i rybozy. Całkowity RNA odnosi się do RNA, który wyekstrahował lub wyizolował z komórek lub tkanek w celu mapowania genetycznego. Ten rodzaj kompletnego RNA można izolować z organizmów jednokomórkowych, tkanek zwierzęcych, tkanek roślinnych, drożdży i grzybów
Całkowity RNA jest ekstrahowany z komórek i tkanek podczas procesu zwanego izolacją RNA. Zakłócenie komórek jest pierwszym i najważniejszym etapem tego procesu, a komórki można zakłócać środkami mechanicznymi, takimi jak homogenizacja lub poprzez dodanie enzymów. Enzymy rozkładają chemicznie powłokę lub kapsułkę komórki, aby można było wydzielić cały RNA. Podczas izolacji całkowitego RNA lipidy, białka i DNA są usuwane z RNA, więc pozostaje on w najczystszej postaci.
Istnieje wiele różnic między RNA i DNA, chociaż dwa nukleotydy łączą się tworząc łańcuchy. RNA jest polimerem jednołańcuchowym, natomiast DNA jest dwuniciowy. Ponadto DNA zawiera dezoksyrybozę, podczas gdy RNA zawiera tylko rybozę.
Chociaż najbardziej podstawową strukturą RNA jest łańcuch, RNA może mieć struktury drugorzędowe i trzeciorzędowe. Drugorzędne struktury są często spiralne i obejmują spinki do włosów, pętle i kształty podobne do sęków. Struktury trzeciorzędowe są najbardziej złożone i występują, gdy odległe nukleotydy oddziałują ze sobą. Naukowcy wykorzystują te struktury do zrozumienia i określenia funkcji różnych cząsteczek RNA.
Gdy cząsteczka RNA zostanie zsyntetyzowana podczas transkrypcji, musi zostać poddana przetwarzaniu, zanim będzie gotowa do spełnienia zamierzonej funkcji. Przetwarzanie obejmuje zmianę segmentów lub nici określonych nukleotydów. Cząsteczki RNA o różnych funkcjach mają różne nazwy. Na przykład nazywany jest informacyjny RNA (mRNA), ponieważ jest odpowiedzialny za przeniesienie kodu genetycznego z DNA do rybosomów wykorzystywanych podczas syntezy białek.
Synteza białek, naukowo nazywana translacją, wymaga dwóch dodatkowych rodzajów RNA oprócz mRNA. Translacja RNA lub cząsteczki tRNA dostosowują nukleotydy w mRNA do aminokwasów podczas translacji. Cząsteczka RNA odpowiedzialna za łączenie rybosomów z rosnącymi łańcuchami białkowymi nazywa się rRNA. Trzy główne typy RNA muszą być obecne dla wielu funkcji RNA. Ponadto większość mniej powszechnych rodzajów RNA odgrywa rolę w translacji, wykonując niezbędne funkcje w jądrze i cytoplazmie.