Что такое молекулярная графика?

Термин графика относится к рисункам или изображениям, которые созданы в соответствии с правилами математики. Молекулярный относится к молекулам и их компонентам. Поэтому одним из значений молекулярной графики (МГ) является изучение молекул посредством визуализации самих молекул и их составных частей. Молекулярная графика также относится к трехмерным изображениям молекул, которые сделаны для того, чтобы исследовать их и понять их реакции во время реакций и взаимодействий.

Молекулярная графика имеет определенные преимущества перед физическими моделями. Физические модели могут вызвать проблемы, потому что структура затенена, существует ложное представление о гибкости, наложение практически невозможно, или они просто слишком громоздки для работы. Все эти проблемы можно преодолеть с помощью компьютерной графики.

Одним из ключевых применений молекулярной графики является изучение белков и нуклеиновых кислот. База данных белка (PDB) Исследовательского бюро для структурной биоинформатики (RCSB), в которой экспериментальная информация о структурах нуклеиновых кислот, белков и сложных сборок хранится для общего доступа. По состоянию на 27 апреля 2010 года в базе данных было 64 932 структуры. RCSB популяризирует свою функцию, предлагая посетителям создавать 3D-модели вирусов в университете Рутгерса в День Рутгерса. RCSB также спонсирует испытания по моделированию белка на региональных олимпиадах по науке в США. Всемирный банк протеиновых данных (wwPDB) является международной организацией, в которую входят такие группы, как RCSB; PDBe, европейский аналог; и PDBj, японский аналог; принадлежат.

Другая область, в которой молекулярная графика чрезвычайно важна, - это дизайн фармацевтических препаратов. Разработка лекарств с помощью молекулярной графики - также известная как компьютерный дизайн лекарств (CADD), компьютерный молекулярный дизайн (CAMD) или структурный дизайн лекарств (SBDD) - является одним из ключевых научных интересов преподавателей, вовлеченных в Например, специализация в области медицинской химии Университета Содружества Вирджинии в программах для выпускников фармацевтических наук.

Специализированное программное обеспечение для создания молекулярной графики, называемое программным обеспечением для молекулярного дизайна , доступно в ряде коммерческих пакетов. Есть также отдельные версии, посвященные разработке лекарств на основе молекулярной графики. При разработке лекарств особенность стыковки - способность соединять отображаемую молекулу с рецептором - является одним из ключевых атрибутов, которые отличают программное обеспечение для разработки лекарств от других программ молекулярного дизайна.