Что такое ретротранспозон?

Транспозоны - это фрагменты ДНК, которые являются мобильными или могут перемещаться в разные места генетической информации клетки. Перемещаясь в новое место в геноме клетки, транспозоны могут вызывать мутации, а также изменять количество ДНК, обнаруженной в клетке. Их также называют прыгающими генами, и они сгруппированы в две категории: транспозоны класса II и транспозоны класса I, или ретротранспозоны. Разница между этими двумя классами связана с тем, как они движутся; ретротранспозон имеет двухступенчатый процесс движения.

Метод перемещения сегмента ДНК заключается в том, как транспозоны классифицируются в каждой категории. Транспозон класса II - это фрагмент ДНК, который перемещается из одного места в другое. Движение транспозона I класса, или ретротранспозона, намного сложнее и включает в себя два шага для перемещения сегмента ДНК.

Первым шагом для движения ретротранспозона является создание сегмента РНК посредством транскрипции фрагмента ДНК. РНК теперь может свободно перемещаться по всему геному, поскольку она не привязана к цепи ДНК. Когда РНК достигает нового местоположения, специфический фермент, называемый обратной транскриптазой, создает новую цепь ДНК на основе сегмента РНК. Этот новый фрагмент ДНК затем присоединяется к новому месту в геноме.

Когда ретротранспозон транскрибируется обратно в сегмент ДНК из копии РНК, он обычно имеет длинные концевые повторы (LTR) на конце последовательности ДНК. LTR состоят из повторяющихся последовательностей оснований, длина которых может составлять сотни или даже тысячи. Они обычно окружают функциональную часть ДНК, такую ​​как ген, и необходимы для присоединения сегмента ДНК к исходной цепи ДНК. LTR являются одним из способов, с помощью которых ученые могут распознать, что часть ДНК содержит ретротранспозон. Считается, что около 42% всего генома человека состоит из ретротранспозонов.

В связи с тем, что новые копии ДНК создаются путем обратной транскрипции РНК, добавление ретротранспозона является способом увеличения количества ДНК, обнаруживаемой в одной клетке. Если ретротранспозон вставлен в ген или рядом с геном, то это может вызвать мутацию. Мутации - это, в основном, изменения в последовательности ДНК, которые могут оказывать положительное, отрицательное влияние или вообще не влиять на геном, в зависимости от того, как изменяется последовательность ДНК.